29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3241 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3241  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.784932  normal  0.111789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3468  hypothetical protein  85.71 
 
 		 260 aa  368  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0908989  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2946  hypothetical protein  51.91 
 
 		 229 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000405982  decreased coverage  0.00000258322 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21290  hypothetical protein  49.73 
 
 		 369 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000179213  normal  0.0805722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3158  hypothetical protein  48.72 
 
 		 213 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000133093  hitchhiker  0.000163581 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2040  hypothetical protein  46.47 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.681258  normal  0.442644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1895  hypothetical protein  41.88 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22937  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2289  hypothetical protein  38.67 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.389058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5242  hypothetical protein  43.17 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0993  hypothetical protein  39.01 
 
 		 227 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4899  hypothetical protein  37.64 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1746  hypothetical protein  31.68 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0922  hypothetical protein  40 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8989  hypothetical protein  36.49 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1185  hypothetical protein  33.09 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000104855  hitchhiker  0.00383042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15760  hypothetical protein  36.76 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0643292  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1174  hypothetical protein  37.5 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13429  hypothetical protein  41.13 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000128583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1201  hypothetical protein  37.5 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0195637 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1191  hypothetical protein  37.5 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1522  hypothetical protein  36.79 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3475  hypothetical protein  36.31 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  36.67 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  37.66 
 
 		 347 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  33.33 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  34.44 
 
 		 355 aa  42.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0425  recA protein  34.34 
 
 		 348 aa  42.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2373  recombinase A  34.57 
 
 		 357 aa  42.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263861  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  35.56 
 
 		 363 aa  42  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>