18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15760 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_15760  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  488  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0643292  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2289  hypothetical protein  39.18 
 
 
317 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.389058  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3158  hypothetical protein  45.22 
 
 
213 aa  95.9  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000133093  hitchhiker  0.000163581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2946  hypothetical protein  36.22 
 
 
229 aa  95.1  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000405982  decreased coverage  0.00000258322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2040  hypothetical protein  40.78 
 
 
314 aa  86.3  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.681258  normal  0.442644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21290  hypothetical protein  40.91 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000179213  normal  0.0805722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5242  hypothetical protein  34.9 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3475  hypothetical protein  39.47 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1895  hypothetical protein  34.55 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1746  hypothetical protein  32.39 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3468  hypothetical protein  38.38 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0908989  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0993  hypothetical protein  29.17 
 
 
227 aa  59.3  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3241  hypothetical protein  36.76 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.784932  normal  0.111789 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1185  hypothetical protein  27.07 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000104855  hitchhiker  0.00383042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4899  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1522  hypothetical protein  33.12 
 
 
235 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8989  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370697  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13429  hypothetical protein  40.3 
 
 
204 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000128583  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>