23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2040 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2040  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  579  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.681258  normal  0.442644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21290  hypothetical protein  47.62 
 
 
369 aa  176  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000179213  normal  0.0805722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2946  hypothetical protein  43.66 
 
 
229 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000405982  decreased coverage  0.00000258322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2289  hypothetical protein  53.33 
 
 
317 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.389058  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3468  hypothetical protein  46.04 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0908989  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3241  hypothetical protein  47.83 
 
 
285 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.784932  normal  0.111789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3158  hypothetical protein  45.12 
 
 
213 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000133093  hitchhiker  0.000163581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1746  hypothetical protein  35.62 
 
 
249 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4899  hypothetical protein  42.01 
 
 
229 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0993  hypothetical protein  39.66 
 
 
227 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15760  hypothetical protein  41.24 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0643292  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1895  hypothetical protein  42.94 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1522  hypothetical protein  46.81 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1174  hypothetical protein  40.94 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1201  hypothetical protein  40.94 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0195637 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1191  hypothetical protein  40.94 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1439  hypothetical protein  58.75 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13429  hypothetical protein  39.34 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000128583  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5242  hypothetical protein  37.68 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1185  hypothetical protein  30.98 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000104855  hitchhiker  0.00383042 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3475  hypothetical protein  41.51 
 
 
230 aa  63.2  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0922  hypothetical protein  45.26 
 
 
241 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8989  hypothetical protein  32.33 
 
 
218 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370697  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>