22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2289 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2289  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.389058  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2040  hypothetical protein  53.74 
 
 
314 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.681258  normal  0.442644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21290  hypothetical protein  41.28 
 
 
369 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000179213  normal  0.0805722 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3468  hypothetical protein  42 
 
 
260 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0908989  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2946  hypothetical protein  39.88 
 
 
229 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000405982  decreased coverage  0.00000258322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3241  hypothetical protein  38.67 
 
 
285 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.784932  normal  0.111789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3158  hypothetical protein  40.72 
 
 
213 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000133093  hitchhiker  0.000163581 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15760  hypothetical protein  38.66 
 
 
263 aa  99  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0643292  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4899  hypothetical protein  38.34 
 
 
229 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0993  hypothetical protein  40.91 
 
 
227 aa  96.3  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1895  hypothetical protein  41.18 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1522  hypothetical protein  37.11 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5242  hypothetical protein  37.57 
 
 
230 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1746  hypothetical protein  32.43 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1439  hypothetical protein  51.18 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1185  hypothetical protein  30.43 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000104855  hitchhiker  0.00383042 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3475  hypothetical protein  38.98 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1174  hypothetical protein  38.27 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1201  hypothetical protein  38.27 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0195637 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1191  hypothetical protein  38.27 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13429  hypothetical protein  45.45 
 
 
204 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000128583  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0922  hypothetical protein  35.96 
 
 
241 aa  56.2  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>