22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1746 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1746  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  474  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4899  hypothetical protein  45.67 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1522  hypothetical protein  45.19 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13429  hypothetical protein  48.02 
 
 		 204 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000128583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1201  hypothetical protein  45.63 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0195637 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1191  hypothetical protein  45.15 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1174  hypothetical protein  45.15 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0922  hypothetical protein  36.9 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2946  hypothetical protein  31.82 
 
 		 229 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000405982  decreased coverage  0.00000258322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3158  hypothetical protein  35.42 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000133093  hitchhiker  0.000163581 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2040  hypothetical protein  36.36 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.681258  normal  0.442644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21290  hypothetical protein  36.78 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000179213  normal  0.0805722 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3468  hypothetical protein  34.9 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0908989  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3241  hypothetical protein  38.03 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.784932  normal  0.111789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2289  hypothetical protein  32.43 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.389058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5242  hypothetical protein  32.89 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15760  hypothetical protein  32.32 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0643292  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0993  hypothetical protein  29.41 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1895  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  52  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22937  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1185  hypothetical protein  23.85 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000104855  hitchhiker  0.00383042 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3475  hypothetical protein  31.97 
 
 		 230 aa  46.6  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8989  hypothetical protein  33.78 
 
 		 218 aa  42  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>