20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1174 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_1191  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1201  hypothetical protein  99.57 
 
 
232 aa  440  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0195637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1174  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4899  hypothetical protein  75.23 
 
 
229 aa  307  8e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1522  hypothetical protein  72.77 
 
 
235 aa  280  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13429  hypothetical protein  63.96 
 
 
204 aa  216  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000128583  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1746  hypothetical protein  45.15 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0922  hypothetical protein  43.64 
 
 
241 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3158  hypothetical protein  44.27 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000133093  hitchhiker  0.000163581 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2040  hypothetical protein  41.4 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.681258  normal  0.442644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21290  hypothetical protein  35.96 
 
 
369 aa  75.5  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000179213  normal  0.0805722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2946  hypothetical protein  32.4 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000405982  decreased coverage  0.00000258322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2289  hypothetical protein  38.27 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.389058  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1895  hypothetical protein  40.16 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22937  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3241  hypothetical protein  39.35 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.784932  normal  0.111789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3468  hypothetical protein  37.42 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0908989  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0993  hypothetical protein  38.28 
 
 
227 aa  62  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3475  hypothetical protein  32.43 
 
 
230 aa  55.1  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5242  hypothetical protein  43.01 
 
 
230 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1185  hypothetical protein  28.3 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000104855  hitchhiker  0.00383042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>