20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0922 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0922  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  457  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4899  hypothetical protein  48.85 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1522  hypothetical protein  47.35 
 
 		 235 aa  148  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1746  hypothetical protein  36.24 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1201  hypothetical protein  46.36 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0195637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1174  hypothetical protein  46.36 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1191  hypothetical protein  46.36 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13429  hypothetical protein  49.69 
 
 		 204 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000128583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2946  hypothetical protein  35.26 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000405982  decreased coverage  0.00000258322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3158  hypothetical protein  40.68 
 
 		 213 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000133093  hitchhiker  0.000163581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3241  hypothetical protein  40.14 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.784932  normal  0.111789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3468  hypothetical protein  38.73 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0908989  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21290  hypothetical protein  32.34 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000179213  normal  0.0805722 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2040  hypothetical protein  37.91 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.681258  normal  0.442644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1185  hypothetical protein  27.33 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000104855  hitchhiker  0.00383042 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0993  hypothetical protein  30.91 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2289  hypothetical protein  35.33 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.389058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1895  hypothetical protein  33.52 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22937  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3475  hypothetical protein  33.55 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5242  hypothetical protein  34.46 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>