66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1686 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1686  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 68 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  44.26 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3042  50S ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173164  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  45.31 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 65 aa  48.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  50 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0461  ribosomal protein L35  56.06 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000342936  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0189  50S ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1384  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000768354  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  51.61 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  45.9 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1313  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.711955  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  44.26 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  60.47 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  44.26 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  42.62 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  44.26 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  52.08 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  44.26 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  52.08 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  58.14 
 
 		 65 aa  43.5  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  40.98 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  44.26 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  45.9 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  40.98 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_002936  DET0751  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000137261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  42.62 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  46.67 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  42.62 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  42.62 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  48.98 
 
 		 65 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  45 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1556  ribosomal protein L35  49.15 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.637628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0679  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000758197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_657  ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000644452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  45.9 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  42.19 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  51.16 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  44.26 
 
 		 63 aa  40  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  39.34 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>