More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0280 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0280  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
119 aa  215  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000492144  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  51.82 
 
 
106 aa  97.1  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0670  50S ribosomal protein L24  55.14 
 
 
105 aa  94  6e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 
108 aa  92  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 
106 aa  89  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  47.22 
 
 
107 aa  87.8  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
103 aa  87.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  44.86 
 
 
105 aa  87  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 
105 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0276  50S ribosomal protein L24  43.48 
 
 
118 aa  84.3  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000858967  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  46.73 
 
 
109 aa  84.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  43.12 
 
 
109 aa  83.6  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  51.38 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  46.73 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
105 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  51.38 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
105 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  51.38 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  51.38 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  51.38 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  51.38 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  51.38 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  51.38 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  49.54 
 
 
103 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  51.38 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  51.38 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  51.38 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
102 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0290  50S ribosomal protein L24  44.14 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000794802  hitchhiker  0.00000184934 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  48.6 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
106 aa  81.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
106 aa  81.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0334  ribosomal protein L24  43.64 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000366107  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  42.59 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  48.18 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  44.95 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  44.04 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  41.28 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  41.28 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0598  ribosomal protein L24  44.25 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  43.12 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  45.37 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  45.79 
 
 
105 aa  80.1  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  44.86 
 
 
104 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  45.87 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  42.2 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3938  50S ribosomal protein L24  50.91 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  46.79 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3327  50S ribosomal protein L24  45.95 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000922916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  42.06 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  47.32 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  43.93 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  42.06 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  44.95 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  43.12 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0380  50S ribosomal protein L24  44.74 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0970  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000143141  hitchhiker  0.000000947265 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1718  50S ribosomal protein L24  43.93 
 
 
111 aa  77  0.00000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  39.45 
 
 
104 aa  77  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0306  ribosomal protein L24  42.73 
 
 
104 aa  77  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0004461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  39.29 
 
 
110 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2361  50S ribosomal protein L24  44.14 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.449778  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  43.4 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0405  50S ribosomal protein L24  43.86 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0416  50S ribosomal protein L24P  44.14 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000110454  normal  0.227235 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  42.99 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  44.86 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4232  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000941051  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  38.39 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4265  50S ribosomal protein L24  45.05 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655615  unclonable  0.00000000000267825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0330  50S ribosomal protein L24  43.24 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.5069e-23  unclonable  0.0000000479114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  43.12 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0778  ribosomal protein L24  44.55 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000331203  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  43.93 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  42.06 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  43.24 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  42.27 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  43.93 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  37.61 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3811  50S ribosomal protein L24  43.93 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0594  50S ribosomal protein L24  42.99 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000014526  normal  0.407014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3903  50S ribosomal protein L24  42.99 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000356583  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0384  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000110242  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0294  50S ribosomal protein L24  42.99 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000911949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>