46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3280 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3280  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  164  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1314  hypothetical protein  88.89 
 
 		 81 aa  151  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000026782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1244  hypothetical protein  88.89 
 
 		 81 aa  151  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1294  hypothetical protein  87.65 
 
 		 81 aa  149  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3133  hypothetical protein  85.19 
 
 		 81 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143017  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2989  hypothetical protein  85.19 
 
 		 81 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.992485  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2975  hypothetical protein  85.19 
 
 		 81 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000873818  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1388  protein of unknown function DUF465  85.19 
 
 		 81 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  63.16 
 
 		 81 aa  100  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  57.14 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3963  hypothetical protein  53.85 
 
 		 79 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1754  hypothetical protein  53.25 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.427593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3745  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3391  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0577  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0834  hypothetical protein  48.1 
 
 		 81 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1355  hypothetical protein  46.25 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3628  hypothetical protein  48.68 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000561848  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1538  hypothetical protein  48.05 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0059018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000608  hypothetical protein  44.16 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000125444  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06468  hypothetical protein  44.16 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  44.74 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3234  hypothetical protein  42.47 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  46.15 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  40.26 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  43.08 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6133  hypothetical protein  36.62 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3788  hypothetical protein  39.13 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  37.33 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  36.62 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61010  hypothetical protein  36.99 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0426  hypothetical protein  35.21 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751467  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0753  hypothetical protein  36.99 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0715  protein of unknown function DUF465  33.33 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5251  hypothetical protein  35.62 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1847  hypothetical protein  32.47 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301519  normal  0.093539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1817  protein of unknown function DUF465  38.46 
 
 		 73 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0116394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0859  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000472034  hitchhiker  0.0000091308 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41080  hypothetical protein  33.8 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1528  hypothetical protein  37.18 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  normal  0.202496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0754  hypothetical protein  34.25 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3645  hypothetical protein  30.26 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169985  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2120  hypothetical protein  32.86 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2030  hypothetical protein  30 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171486  hitchhiker  0.0000000000000487786 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4761  hypothetical protein  34.78 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544295  normal  0.403355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>