47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3234 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3234  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  168  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3628  hypothetical protein  80.52 
 
 		 81 aa  134  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000561848  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0834  hypothetical protein  74.03 
 
 		 81 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1538  hypothetical protein  66.67 
 
 		 81 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0059018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000608  hypothetical protein  60.76 
 
 		 79 aa  100  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000125444  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06468  hypothetical protein  59.21 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1355  hypothetical protein  58.75 
 
 		 81 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3745  hypothetical protein  51.28 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3391  hypothetical protein  51.32 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3963  hypothetical protein  46.84 
 
 		 79 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1754  hypothetical protein  45.45 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.427593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0577  hypothetical protein  47.37 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  45.12 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  43.42 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1244  hypothetical protein  46.58 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1314  hypothetical protein  46.58 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000026782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1294  hypothetical protein  46.58 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3280  hypothetical protein  42.47 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2975  hypothetical protein  43.84 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000873818  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1388  protein of unknown function DUF465  43.84 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2989  hypothetical protein  43.84 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.992485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3133  hypothetical protein  43.84 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143017  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3788  hypothetical protein  42.11 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61010  hypothetical protein  35.44 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  35.71 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0754  hypothetical protein  38.67 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0753  hypothetical protein  37.66 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0859  hypothetical protein  35.21 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000472034  hitchhiker  0.0000091308 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  34.29 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5251  hypothetical protein  34.18 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  36.99 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0715  protein of unknown function DUF465  29.33 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1880  hypothetical protein  32.43 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  38.03 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  36.23 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0459  hypothetical protein  37.7 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4690  hypothetical protein  31.43 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906435  normal  0.0131343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1528  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  43.5  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  normal  0.202496 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  35.9 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0459  hypothetical protein  37.1 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4510  hypothetical protein  36.07 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148318  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6133  hypothetical protein  29.85 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  26.83 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0446  hypothetical protein  35.71 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00475096  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4134  hypothetical protein  35.71 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41080  hypothetical protein  31.08 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>