49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3963 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3963  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1355  hypothetical protein  56.76 
 
 		 81 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1388  protein of unknown function DUF465  52.56 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3133  hypothetical protein  52.56 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143017  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2989  hypothetical protein  52.56 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.992485  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2975  hypothetical protein  52.56 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000873818  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3280  hypothetical protein  53.85 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1314  hypothetical protein  51.28 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000026782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1244  hypothetical protein  51.28 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1538  hypothetical protein  51.9 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0059018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1294  hypothetical protein  51.28 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0834  hypothetical protein  49.35 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  48.65 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  51.95 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1754  hypothetical protein  49.35 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.427593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3628  hypothetical protein  46.75 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000561848  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3234  hypothetical protein  46.84 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06468  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3391  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3745  hypothetical protein  48.65 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000608  hypothetical protein  46.58 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000125444  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0577  hypothetical protein  45.95 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3788  hypothetical protein  41.1 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  35.9 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  39.24 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  36.84 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  42.65 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6133  hypothetical protein  35.14 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  39.71 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0715  protein of unknown function DUF465  32.43 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1847  hypothetical protein  32.91 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301519  normal  0.093539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1114  hypothetical protein  41.43 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601711  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4690  hypothetical protein  41.18 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906435  normal  0.0131343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0426  hypothetical protein  30.99 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751467  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1817  protein of unknown function DUF465  37.1 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0116394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0859  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000472034  hitchhiker  0.0000091308 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02520  hypothetical protein  36.76 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148318  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0754  hypothetical protein  32.91 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4858  hypothetical protein  34.33 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400364  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4761  hypothetical protein  36.92 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544295  normal  0.403355 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4134  hypothetical protein  34.38 
 
 		 70 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1528  hypothetical protein  37.5 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  normal  0.202496 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1438  hypothetical protein  29.33 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.119684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1761  hypothetical protein  29.33 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1880  hypothetical protein  28.38 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3506  hypothetical protein  32.81 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00012483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3681  hypothetical protein  32.81 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0122929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0753  hypothetical protein  31.58 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>