35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3745 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3745  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3391  hypothetical protein  90.12 
 
 		 90 aa  149  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0577  hypothetical protein  83.95 
 
 		 87 aa  142  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1754  hypothetical protein  66.25 
 
 		 84 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.427593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3628  hypothetical protein  55.26 
 
 		 81 aa  87  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000561848  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3234  hypothetical protein  51.28 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0834  hypothetical protein  52.63 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1355  hypothetical protein  51.28 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2989  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.992485  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1388  protein of unknown function DUF465  50 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3133  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143017  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1294  hypothetical protein  48.68 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1538  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0059018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2975  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000873818  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3280  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1314  hypothetical protein  48.68 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000026782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1244  hypothetical protein  48.68 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  45.57 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3963  hypothetical protein  48.65 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  46.84 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06468  hypothetical protein  46.05 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000608  hypothetical protein  46.05 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000125444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  38.16 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3788  hypothetical protein  37.14 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  38.96 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  35.44 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1528  hypothetical protein  38.89 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  normal  0.202496 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1847  hypothetical protein  35.53 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301519  normal  0.093539 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  39.44 
 
 		 78 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61010  hypothetical protein  35.14 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0754  hypothetical protein  36.49 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0753  hypothetical protein  38.81 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5251  hypothetical protein  33.78 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  34.33 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  32.84 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>