48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0753 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0753  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  164  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5251  hypothetical protein  65 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61010  hypothetical protein  63.75 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0754  hypothetical protein  57.5 
 
 		 92 aa  92  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41080  hypothetical protein  50.65 
 
 		 85 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3788  hypothetical protein  33.77 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  40.51 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  40.26 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0859  hypothetical protein  38.16 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000472034  hitchhiker  0.0000091308 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1761  hypothetical protein  41.67 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1438  hypothetical protein  41.67 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.119684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1880  hypothetical protein  35.14 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6133  hypothetical protein  39.19 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0426  hypothetical protein  40.85 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751467  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1528  hypothetical protein  37.66 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  normal  0.202496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0834  hypothetical protein  41.1 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  35.21 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1314  hypothetical protein  39.73 
 
 		 81 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000026782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1244  hypothetical protein  39.73 
 
 		 81 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1294  hypothetical protein  39.73 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3645  hypothetical protein  37.84 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169985  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3920  hypothetical protein  38.36 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.787239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3628  hypothetical protein  42.03 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000561848  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06468  hypothetical protein  35.53 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000608  hypothetical protein  40.3 
 
 		 79 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000125444  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3234  hypothetical protein  37.66 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0154  hypothetical protein  37.84 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000241141  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  32.88 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0175  hypothetical protein  37.84 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.025388  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3280  hypothetical protein  36.99 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  36.36 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0715  protein of unknown function DUF465  34.67 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1355  hypothetical protein  37.31 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  31.88 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  36.99 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  31.58 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3391  hypothetical protein  38.81 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1847  hypothetical protein  35.14 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301519  normal  0.093539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1538  hypothetical protein  35.06 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0059018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2989  hypothetical protein  34.25 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.992485  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1388  protein of unknown function DUF465  34.25 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3133  hypothetical protein  34.25 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143017  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2975  hypothetical protein  34.25 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000873818  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  33.82 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3745  hypothetical protein  38.81 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1457  hypothetical protein  30.43 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000018959  normal  0.369209 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3963  hypothetical protein  31.58 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1031  conserved hypothetical protein (DUF465 domain protein)  38.89 
 
 		 71 aa  40  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.453831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>