43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3645 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3645  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  158  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169985  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0175  hypothetical protein  56.58 
 
 		 79 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.025388  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3920  hypothetical protein  56.76 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.787239  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0154  hypothetical protein  55.26 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000241141  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1880  hypothetical protein  56.58 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0715  protein of unknown function DUF465  50 
 
 		 80 aa  70.5  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0426  hypothetical protein  49.32 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6133  hypothetical protein  46.67 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  41.1 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  48 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  44.59 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1528  hypothetical protein  38.67 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  normal  0.202496 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1847  hypothetical protein  40.79 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301519  normal  0.093539 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  41.33 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  36.84 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61010  hypothetical protein  35.53 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  38.57 
 
 		 72 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  36.62 
 
 		 79 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0753  hypothetical protein  37.84 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0859  hypothetical protein  35.53 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000472034  hitchhiker  0.0000091308 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41080  hypothetical protein  30.67 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3788  hypothetical protein  31.08 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5251  hypothetical protein  34.21 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2975  hypothetical protein  31.94 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000873818  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1388  protein of unknown function DUF465  31.94 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3133  hypothetical protein  31.94 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143017  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1244  hypothetical protein  31.58 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1314  hypothetical protein  31.58 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000026782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2989  hypothetical protein  31.94 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.992485  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1294  hypothetical protein  31.58 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  33.33 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4690  hypothetical protein  32.86 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906435  normal  0.0131343 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1490  hypothetical protein  35 
 
 		 71 aa  43.9  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0474  hypothetical protein  35 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.366542  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0499  hypothetical protein  35 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.132623  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1438  hypothetical protein  33.82 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.119684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1761  hypothetical protein  33.82 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3280  hypothetical protein  30.26 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  32.86 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4858  hypothetical protein  31.88 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400364  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4761  hypothetical protein  33.85 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544295  normal  0.403355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0754  hypothetical protein  32.43 
 
 		 92 aa  40.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2236  hypothetical protein  36.67 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>