37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0175 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0175  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  161  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.025388  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0154  hypothetical protein  98.73 
 
 		 123 aa  160  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000241141  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3920  hypothetical protein  92.21 
 
 		 79 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.787239  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1880  hypothetical protein  53.16 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0715  protein of unknown function DUF465  51.9 
 
 		 80 aa  86.7  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3645  hypothetical protein  56.58 
 
 		 80 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169985  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1847  hypothetical protein  45.57 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301519  normal  0.093539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0426  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751467  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  45.45 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  46.75 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6133  hypothetical protein  48.1 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  41.1 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1528  hypothetical protein  40.54 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  normal  0.202496 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  37.97 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  38.36 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61010  hypothetical protein  35.14 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0753  hypothetical protein  37.84 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02520  hypothetical protein  35.29 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148318  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0859  hypothetical protein  36.99 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000472034  hitchhiker  0.0000091308 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4690  hypothetical protein  32.35 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906435  normal  0.0131343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41080  hypothetical protein  29.33 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  35.29 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1817  protein of unknown function DUF465  33.85 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0116394  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5251  hypothetical protein  33.78 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1114  hypothetical protein  35.38 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601711  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1490  hypothetical protein  34.43 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0474  hypothetical protein  34.43 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.366542  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06468  hypothetical protein  32.43 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0499  hypothetical protein  34.43 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.132623  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  34.62 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4858  hypothetical protein  33.85 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400364  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  32.35 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0754  hypothetical protein  34.18 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4761  hypothetical protein  35.38 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544295  normal  0.403355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000608  hypothetical protein  31.08 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000125444  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3788  hypothetical protein  28.17 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>