35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_41080 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_41080  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  175  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0754  hypothetical protein  55.13 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5251  hypothetical protein  51.85 
 
 		 84 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61010  hypothetical protein  51.85 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0753  hypothetical protein  50.65 
 
 		 80 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  33.78 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0834  hypothetical protein  38.96 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6133  hypothetical protein  36.36 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  30.88 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000608  hypothetical protein  35.38 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000125444  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  29.87 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3645  hypothetical protein  30.67 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169985  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0426  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751467  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1847  hypothetical protein  32 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301519  normal  0.093539 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1880  hypothetical protein  28 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1294  hypothetical protein  33.8 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3280  hypothetical protein  33.8 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0175  hypothetical protein  29.33 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.025388  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0154  hypothetical protein  29.33 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000241141  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  33.82 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3920  hypothetical protein  29.17 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.787239  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1314  hypothetical protein  32.39 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000026782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0715  protein of unknown function DUF465  27.94 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1244  hypothetical protein  32.39 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  34.72 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06468  hypothetical protein  28.38 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3628  hypothetical protein  30.99 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000561848  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3788  hypothetical protein  27.5 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1538  hypothetical protein  31.08 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0059018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1355  hypothetical protein  30.77 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  31.94 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0577  hypothetical protein  32.05 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  32.35 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3234  hypothetical protein  31.08 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0859  hypothetical protein  28.57 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000472034  hitchhiker  0.0000091308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>