68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2119 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  179  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1847  hypothetical protein  65.38 
 
 		 79 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301519  normal  0.093539 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1880  hypothetical protein  60.26 
 
 		 79 aa  105  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0715  protein of unknown function DUF465  61.04 
 
 		 80 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  56.41 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0175  hypothetical protein  45.45 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.025388  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0426  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751467  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0154  hypothetical protein  44.16 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000241141  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3920  hypothetical protein  45.45 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.787239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6133  hypothetical protein  48.68 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  43.59 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  44.44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  43.28 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0859  hypothetical protein  41.67 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000472034  hitchhiker  0.0000091308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3788  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4690  hypothetical protein  38.16 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906435  normal  0.0131343 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3645  hypothetical protein  44.59 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169985  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  37.5 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61010  hypothetical protein  38.81 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1528  hypothetical protein  37.97 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  normal  0.202496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1817  protein of unknown function DUF465  36.11 
 
 		 73 aa  57  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0116394  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  34.94 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02520  hypothetical protein  38.46 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148318  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5251  hypothetical protein  37.31 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4858  hypothetical protein  34.29 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400364  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2989  hypothetical protein  35.06 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.992485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3133  hypothetical protein  35.06 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143017  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0753  hypothetical protein  35.21 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1388  protein of unknown function DUF465  35.06 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0906  hypothetical protein  31.94 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2975  hypothetical protein  35.06 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000873818  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1114  hypothetical protein  35.38 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601711  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3280  hypothetical protein  36.36 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41080  hypothetical protein  30.88 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1244  hypothetical protein  35.06 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1314  hypothetical protein  35.06 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000026782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3391  hypothetical protein  34.12 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1294  hypothetical protein  35.06 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  35.21 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  34.18 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1761  hypothetical protein  28 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1438  hypothetical protein  28 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.119684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4761  hypothetical protein  35.38 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544295  normal  0.403355 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3745  hypothetical protein  35.44 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0754  hypothetical protein  32.88 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0446  hypothetical protein  34.29 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00475096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1538  hypothetical protein  30.56 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0059018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0487  hypothetical protein  32.39 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000002687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0490  hypothetical protein  32.39 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000900641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3853  hypothetical protein  32.39 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000215717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0466  hypothetical protein  32.39 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000739571  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0577  hypothetical protein  33.73 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4134  hypothetical protein  32.86 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0974  hypothetical protein  30.88 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196541  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3681  hypothetical protein  32.86 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0122929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3506  hypothetical protein  32.86 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00012483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0542  hypothetical protein  31.43 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0502225  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000608  hypothetical protein  29.17 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000125444  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0834  hypothetical protein  28.57 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4510  hypothetical protein  25.35 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0459  hypothetical protein  29.23 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06468  hypothetical protein  27.78 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3234  hypothetical protein  26.83 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1031  conserved hypothetical protein (DUF465 domain protein)  33.82 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.453831  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3404  hypothetical protein  27.78 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0411  hypothetical protein  29.23 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3628  hypothetical protein  27.63 
 
 		 81 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000561848  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1490  hypothetical protein  30.88 
 
 		 71 aa  40  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>