37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3391 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3391  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0577  hypothetical protein  85.54 
 
 
87 aa  150  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3745  hypothetical protein  90.12 
 
 
81 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1754  hypothetical protein  66.25 
 
 
84 aa  111  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.427593  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3628  hypothetical protein  52.63 
 
 
81 aa  84.3  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000561848  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1355  hypothetical protein  52.63 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3234  hypothetical protein  51.32 
 
 
82 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1294  hypothetical protein  48.68 
 
 
81 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0834  hypothetical protein  52.63 
 
 
81 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  48.1 
 
 
81 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3280  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1314  hypothetical protein  48.68 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000026782  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1244  hypothetical protein  48.68 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3133  hypothetical protein  48.68 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143017  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2975  hypothetical protein  48.68 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000873818  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1388  protein of unknown function DUF465  48.68 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2989  hypothetical protein  48.68 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.992485  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1538  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0059018  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3963  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  48.1 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000608  hypothetical protein  44.87 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000125444  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06468  hypothetical protein  44.74 
 
 
87 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  36.84 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3788  hypothetical protein  37.14 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  38.96 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  34.12 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61010  hypothetical protein  35.06 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1528  hypothetical protein  37.18 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  normal  0.202496 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  39.44 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0753  hypothetical protein  38.81 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0754  hypothetical protein  36.49 
 
 
92 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1847  hypothetical protein  34.21 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301519  normal  0.093539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5251  hypothetical protein  33.78 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  34.85 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0715  protein of unknown function DUF465  29.49 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  33.33 
 
 
73 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  31.08 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>