46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06468 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06468  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  179  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000608  hypothetical protein  81.01 
 
 		 79 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000125444  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3234  hypothetical protein  59.21 
 
 		 82 aa  97.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3628  hypothetical protein  59.21 
 
 		 81 aa  98.2  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000561848  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1355  hypothetical protein  55.84 
 
 		 81 aa  92  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0834  hypothetical protein  61.11 
 
 		 81 aa  91.3  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1538  hypothetical protein  54.43 
 
 		 81 aa  90.1  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0059018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3963  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  47.44 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3745  hypothetical protein  46.05 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2975  hypothetical protein  45.45 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000873818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2989  hypothetical protein  45.45 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.992485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3133  hypothetical protein  45.45 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143017  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1314  hypothetical protein  44.16 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000026782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1244  hypothetical protein  44.16 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1388  protein of unknown function DUF465  45.45 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1754  hypothetical protein  43.59 
 
 		 84 aa  67  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.427593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3391  hypothetical protein  44.74 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3280  hypothetical protein  44.16 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  44.44 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1294  hypothetical protein  41.56 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0577  hypothetical protein  42.11 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61010  hypothetical protein  38.16 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5251  hypothetical protein  36.84 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0754  hypothetical protein  36.84 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3788  hypothetical protein  42.03 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  40 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0753  hypothetical protein  35.53 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1528  hypothetical protein  36.84 
 
 		 86 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  normal  0.202496 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0859  hypothetical protein  34.33 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000472034  hitchhiker  0.0000091308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  35.29 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  36.76 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4690  hypothetical protein  36.76 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906435  normal  0.0131343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  31.34 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0175  hypothetical protein  32.43 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.025388  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0715  protein of unknown function DUF465  25.68 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3920  hypothetical protein  32.39 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.787239  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0154  hypothetical protein  32.43 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000241141  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1880  hypothetical protein  30.77 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41080  hypothetical protein  28.38 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  37.68 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4510  hypothetical protein  33.82 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0411  hypothetical protein  35.82 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  27.78 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02520  hypothetical protein  35.29 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148318  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  32.35 
 
 		 72 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>