25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1754 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1754  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  169  9e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.427593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3391  hypothetical protein  66.25 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3745  hypothetical protein  66.25 
 
 		 81 aa  112  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0577  hypothetical protein  63.75 
 
 		 87 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1355  hypothetical protein  51.32 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3280  hypothetical protein  53.25 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1294  hypothetical protein  50.65 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3963  hypothetical protein  49.35 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0834  hypothetical protein  48.15 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1244  hypothetical protein  50.65 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1314  hypothetical protein  50.65 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000026782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3628  hypothetical protein  45.45 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000561848  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1538  hypothetical protein  51.32 
 
 		 81 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0059018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  48.1 
 
 		 81 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1388  protein of unknown function DUF465  49.35 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3133  hypothetical protein  49.35 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143017  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2989  hypothetical protein  49.35 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.992485  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2975  hypothetical protein  49.35 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000873818  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3234  hypothetical protein  45.45 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06468  hypothetical protein  43.59 
 
 		 87 aa  67  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000608  hypothetical protein  43.42 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000125444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  33.77 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0754  hypothetical protein  35.62 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  36.92 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>