50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1847 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1847  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  162  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301519  normal  0.093539 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  65.38 
 
 
88 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  62.82 
 
 
78 aa  103  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0715  protein of unknown function DUF465  60.76 
 
 
80 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1880  hypothetical protein  62.03 
 
 
79 aa  101  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0175  hypothetical protein  45.57 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.025388  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0154  hypothetical protein  44.3 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000241141  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3920  hypothetical protein  46.75 
 
 
79 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.787239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6133  hypothetical protein  46.84 
 
 
91 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713405  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0426  hypothetical protein  46.05 
 
 
82 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751467  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  43.06 
 
 
78 aa  70.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  39.24 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3788  hypothetical protein  39.73 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1528  hypothetical protein  38.03 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  normal  0.202496 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3645  hypothetical protein  40.79 
 
 
80 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169985  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  39.71 
 
 
72 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02520  hypothetical protein  39.71 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148318  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  38.16 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4690  hypothetical protein  33.82 
 
 
73 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906435  normal  0.0131343 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4858  hypothetical protein  37.31 
 
 
71 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400364  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1314  hypothetical protein  35.06 
 
 
81 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000026782  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1244  hypothetical protein  35.06 
 
 
81 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2975  hypothetical protein  33.77 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000873818  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3133  hypothetical protein  33.77 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143017  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  36.36 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1817  protein of unknown function DUF465  35.29 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0116394  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1114  hypothetical protein  36.92 
 
 
71 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2989  hypothetical protein  33.77 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.992485  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1388  protein of unknown function DUF465  33.77 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  38.24 
 
 
73 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1294  hypothetical protein  33.77 
 
 
81 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61010  hypothetical protein  35.44 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0859  hypothetical protein  38.67 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000472034  hitchhiker  0.0000091308 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3963  hypothetical protein  32.91 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  34.25 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4761  hypothetical protein  32.84 
 
 
72 aa  47.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544295  normal  0.403355 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1761  hypothetical protein  34.25 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1438  hypothetical protein  34.25 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.119684  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41080  hypothetical protein  32 
 
 
85 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3745  hypothetical protein  35.53 
 
 
81 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3280  hypothetical protein  32.47 
 
 
81 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5251  hypothetical protein  34.18 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0754  hypothetical protein  35.14 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0753  hypothetical protein  35.14 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3391  hypothetical protein  34.21 
 
 
90 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1490  hypothetical protein  36.51 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2236  hypothetical protein  32.84 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0499  hypothetical protein  36.51 
 
 
71 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.132623  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0474  hypothetical protein  36.51 
 
 
71 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.366542  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000608  hypothetical protein  27.85 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000125444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>