39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6133 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6133  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0426  hypothetical protein  77.5 
 
 		 82 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751467  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0715  protein of unknown function DUF465  60.76 
 
 		 80 aa  95.5  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1880  hypothetical protein  52.78 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  54.17 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1847  hypothetical protein  46.84 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301519  normal  0.093539 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0154  hypothetical protein  48.1 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000241141  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0175  hypothetical protein  48.1 
 
 		 79 aa  73.9  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.025388  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  48.68 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3920  hypothetical protein  47.37 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.787239  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3645  hypothetical protein  46.67 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169985  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  39.44 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  41.1 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1314  hypothetical protein  39.44 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000026782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1244  hypothetical protein  39.44 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1294  hypothetical protein  39.44 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2975  hypothetical protein  36.62 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000873818  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3280  hypothetical protein  36.62 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3133  hypothetical protein  36.62 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143017  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1388  protein of unknown function DUF465  36.62 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2989  hypothetical protein  36.62 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.992485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  36.84 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0753  hypothetical protein  39.19 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3963  hypothetical protein  35.14 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3788  hypothetical protein  32.39 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41080  hypothetical protein  36.36 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1528  hypothetical protein  30.86 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  normal  0.202496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0754  hypothetical protein  35.21 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  34.21 
 
 		 84 aa  48.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0859  hypothetical protein  32.93 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000472034  hitchhiker  0.0000091308 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61010  hypothetical protein  32.43 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1538  hypothetical protein  30.67 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0059018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0834  hypothetical protein  29.58 
 
 		 81 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5251  hypothetical protein  31.08 
 
 		 84 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3234  hypothetical protein  29.85 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4690  hypothetical protein  29.23 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906435  normal  0.0131343 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000608  hypothetical protein  28.57 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000125444  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3628  hypothetical protein  28.17 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000561848  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>