268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1355 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1930  heat shock protein  100 
 
 
156 aa  323  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.284757  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1355  heat shock protein  100 
 
 
156 aa  323  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0360628 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1339  heat shock protein  99.36 
 
 
156 aa  321  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1370  heat shock protein  99.36 
 
 
156 aa  321  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.680971  normal  0.221447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2114  heat shock protein  99.36 
 
 
156 aa  321  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00491834 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2475  heat shock protein Hsp20  58.39 
 
 
162 aa  197  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0538746  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2379  heat shock protein Hsp20  60.26 
 
 
160 aa  194  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0037  heat shock protein  43.62 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.487724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3739  small heat shock protein  39.13 
 
 
155 aa  97.1  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0012  heat shock chaperone IbpB  36.59 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3794  heat shock chaperone IbpB  36.59 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.82162  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2213  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4142  heat shock chaperone IbpB  36.59 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0559  heat shock protein Hsp20  32.47 
 
 
154 aa  94  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2141  global stress protein GspA  34.25 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2116  global stress protein GspA  34.25 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4119  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
160 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336611  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0049  heat shock chaperone IbpB  35.2 
 
 
142 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.206343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4630  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
162 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127451  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4263  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
167 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0433  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 
164 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2726  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
160 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.239135  normal  0.135003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0763  heat shock protein Hsp20  31.61 
 
 
158 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.50457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  31.48 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  31.48 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3877  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
159 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.446606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0872  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.790875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3321  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2006  heat-shock protein IbpA  30.67 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3620  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23680  heat-shock protein IbpA  30.67 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598173 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  30.34 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1980  heat shock protein Hsp20  30.87 
 
 
147 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168332  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2952  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
153 aa  87.4  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1139  heat shock protein Hsp20  34.67 
 
 
153 aa  87  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  30.28 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0957  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.634441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1373  small heat shock protein  32.45 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.272184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0014  heat shock chaperone IbpB  32.8 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2892  putative small heat shock (HSP20) protein  30.46 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00328323  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  29.8 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34300  heat shock protein IbpA  31.33 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901315  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1883  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0695  heat shock protein Hsp20  32.24 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2837  molecular chaperone (small heat shock protein)  30.92 
 
 
160 aa  85.1  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00175036  normal  0.201531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0040  heat shock chaperone IbpB  32.84 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  33.33 
 
 
137 aa  84.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4533  heat shock protein Hsp20  32.05 
 
 
158 aa  84.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2821  heat shock protein Hsp20  34.18 
 
 
161 aa  84.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13645  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4556  heat shock protein Hsp20  37.69 
 
 
156 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5016  heat shock protein Hsp20  37.69 
 
 
156 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  37.69 
 
 
156 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3020  heat shock protein Hsp20  32.92 
 
 
165 aa  84  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2501  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 
158 aa  84  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3777  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 
147 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.732741 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4143  heat shock protein IbpA  36.29 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2170  heat shock protein, Hsp20 family  28.67 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3795  heat shock protein IbpA  36.29 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  28.87 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0011  heat shock protein IbpA  36.29 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4279  heat shock protein Hsp20  37.9 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0035  heat shock chaperone IbpB  32.33 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1982  heat shock protein Hsp20  30.26 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.01007  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2505  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167107  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38620  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  30.82 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  34.11 
 
 
160 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  31.94 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0619  heat shock protein Hsp20  31.79 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2073  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1322  normal  0.515906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  31.94 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0051  16 kDa heat shock protein A  33.06 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  31.94 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  31.94 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  31.94 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4105  heat shock protein IbpA  33.58 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  31.69 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  32.54 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  29.05 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1513  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0039  heat shock protein IbpA  36.29 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4104  heat shock chaperone IbpB  33.06 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0034  heat shock protein IbpA  36.29 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4198  heat shock protein IbpA  32.41 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38610  heat shock protein Hsp20  28.67 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2715  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298562  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4036  heat shock protein IbpA  32.41 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4140  heat shock protein IbpA  32.41 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4091  heat shock protein IbpA  32.41 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1545  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2632  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3580  chaperone protein IbpA  33.08 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3914  heat shock protein IbpA  35.48 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1754  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.19811  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0614  Hsp20/alpha crystallin family protein  31.75 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>