232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2726 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2726  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 160 aa  322  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.239135  normal  0.135003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2006  heat-shock protein IbpA  81.21 
 
 		 149 aa  248  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23680  heat-shock protein IbpA  80.54 
 
 		 149 aa  247  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1982  heat shock protein Hsp20  79.19 
 
 		 149 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.01007  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3777  heat shock protein Hsp20  80.27 
 
 		 147 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.732741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34300  heat shock protein IbpA  77.55 
 
 		 147 aa  236  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1513  heat shock protein Hsp20  78.23 
 
 		 147 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1545  heat shock protein Hsp20  78.23 
 
 		 147 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1883  heat shock protein Hsp20  74.5 
 
 		 147 aa  227  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1980  heat shock protein Hsp20  74.5 
 
 		 147 aa  226  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168332  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2170  heat shock protein, Hsp20 family  73.61 
 
 		 147 aa  223  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38620  heat shock protein Hsp20  70.86 
 
 		 152 aa  220  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38610  heat shock protein Hsp20  70.2 
 
 		 152 aa  216  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2141  global stress protein GspA  52.48 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2116  global stress protein GspA  52.48 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2892  putative small heat shock (HSP20) protein  52.38 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00328323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5227  heat shock protein Hsp20  50.71 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0487576  normal  0.385827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2746  heat shock protein Hsp20  47.06 
 
 		 168 aa  140  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145564  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  51.05 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4143  heat shock protein IbpA  51.49 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0011  heat shock protein IbpA  51.49 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  48.97 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3795  heat shock protein IbpA  51.49 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2837  molecular chaperone (small heat shock protein)  47.62 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00175036  normal  0.201531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1600  aminodeoxychorismate lyase  47.79 
 
 		 169 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000328737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  49.65 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0433  heat shock protein Hsp20  47.52 
 
 		 164 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  48.53 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2821  heat shock protein Hsp20  49.28 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13645  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4556  heat shock protein Hsp20  47.18 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5016  heat shock protein Hsp20  47.18 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5555  heat shock protein Hsp20  49.65 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148025 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4198  heat shock protein IbpA  49.3 
 
 		 139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4140  heat shock protein IbpA  49.3 
 
 		 139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4036  heat shock protein IbpA  49.3 
 
 		 139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  48.23 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4091  heat shock protein IbpA  49.3 
 
 		 139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  48.23 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  46.48 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4019  heat shock protein IbpA  50 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3321  heat shock protein Hsp20  46.76 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  50.72 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3620  heat shock protein Hsp20  46.76 
 
 		 156 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4279  heat shock protein Hsp20  45.32 
 
 		 156 aa  133  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  49.26 
 
 		 137 aa  133  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2891  heat shock protein Hsp20  44.06 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.457656  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0014  heat shock chaperone IbpB  47.52 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  50 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3510  heat shock protein Hsp20  48.23 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.420499  normal  0.371318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  45.26 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  47.83 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  49.28 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  49.26 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2073  heat shock protein Hsp20  46.62 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1322  normal  0.515906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  49.28 
 
 		 147 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  49.28 
 
 		 147 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  49.28 
 
 		 147 aa  132  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  45.26 
 
 		 155 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0051  16 kDa heat shock protein A  47.45 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3892  heat shock protein Hsp20  45 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03570  heat shock chaperone  50.36 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  50.36 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  48.55 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2213  heat shock protein Hsp20  47.52 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  48.55 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  50.36 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  50.36 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  48.55 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  50.36 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4052  heat shock protein IbpA  50.36 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5119  heat shock protein IbpA  50.36 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188059 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  50.36 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  48.55 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03514  hypothetical protein  50.36 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  48.55 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2715  heat shock protein Hsp20  46.72 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1531  heat shock protein Hsp20  48.23 
 
 		 156 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280611  normal  0.217499 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3145  heat shock protein Hsp20  44.06 
 
 		 182 aa  130  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4636  heat shock protein Hsp20  46.43 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0695  heat shock protein Hsp20  47.41 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3020  heat shock protein Hsp20  44.68 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2632  heat shock protein Hsp20  45.89 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4263  heat shock protein Hsp20  46.38 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135314 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4233  heat shock chaperone IbpB  48.25 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2014  heat shock protein Hsp20  45.45 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.918897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  50.75 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3739  small heat shock protein  45.71 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4630  heat shock protein Hsp20  46.38 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02239  small heat shock protein  40.67 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6473  heat shock protein Hsp20  46.48 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0559  heat shock protein Hsp20  47.62 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4119  heat shock protein Hsp20  47.41 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336611  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  46.72 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0039  heat shock protein IbpA  49.26 
 
 		 137 aa  127  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4311  heat shock protein Hsp20  46.43 
 
 		 153 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4551  heat shock protein Hsp20  46.43 
 
 		 153 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.448918  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0034  heat shock protein IbpA  49.26 
 
 		 137 aa  127  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0017  heat shock chaperone IbpB  48.23 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>