274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2170 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2170  heat shock protein, Hsp20 family  100 
 
 		 147 aa  303  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1980  heat shock protein Hsp20  96.55 
 
 		 147 aa  290  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168332  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1545  heat shock protein Hsp20  80.42 
 
 		 147 aa  237  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1513  heat shock protein Hsp20  79.72 
 
 		 147 aa  236  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3777  heat shock protein Hsp20  78.32 
 
 		 147 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.732741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2006  heat-shock protein IbpA  79.02 
 
 		 149 aa  236  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1982  heat shock protein Hsp20  78.32 
 
 		 149 aa  234  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.01007  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23680  heat-shock protein IbpA  79.02 
 
 		 149 aa  234  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598173 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2726  heat shock protein Hsp20  73.61 
 
 		 160 aa  223  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.239135  normal  0.135003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1883  heat shock protein Hsp20  74.29 
 
 		 147 aa  216  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34300  heat shock protein IbpA  70.21 
 
 		 147 aa  214  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901315  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38620  heat shock protein Hsp20  68.06 
 
 		 152 aa  200  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38610  heat shock protein Hsp20  68.06 
 
 		 152 aa  197  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2141  global stress protein GspA  48.94 
 
 		 166 aa  150  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5227  heat shock protein Hsp20  48.28 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0487576  normal  0.385827 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2116  global stress protein GspA  48.23 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2746  heat shock protein Hsp20  48.12 
 
 		 168 aa  141  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145564  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  47.55 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  48.25 
 
 		 147 aa  140  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  50.71 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  46.85 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  46.72 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  46.72 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  46.85 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  46.85 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  46.85 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  46.85 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2837  molecular chaperone (small heat shock protein)  51.08 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00175036  normal  0.201531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  46.85 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  46.85 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  46.85 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  46.85 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  47.52 
 
 		 147 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  44.93 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0433  heat shock protein Hsp20  45.59 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3321  heat shock protein Hsp20  44.93 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5016  heat shock protein Hsp20  44.93 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3620  heat shock protein Hsp20  44.93 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4556  heat shock protein Hsp20  44.93 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2821  heat shock protein Hsp20  46.38 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13645  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  47.45 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1600  aminodeoxychorismate lyase  45 
 
 		 169 aa  133  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000328737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4139  heat shock chaperone IbpB  43.36 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2505  heat shock protein Hsp20  47.41 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0957  heat shock protein Hsp20  43.07 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.634441  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4090  heat shock chaperone IbpB  43.36 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4035  heat shock chaperone IbpB  43.36 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4018  heat shock chaperone IbpB  43.36 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4197  heat shock chaperone IbpB  43.36 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5641  heat shock protein Hsp20  47.48 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.41012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0014  heat shock chaperone IbpB  44.68 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3145  heat shock protein Hsp20  44.83 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3739  small heat shock protein  44.6 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  45.59 
 
 		 160 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  45.59 
 
 		 160 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0763  heat shock protein Hsp20  44.6 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.50457 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2501  heat shock protein Hsp20  47.79 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3795  heat shock protein IbpA  50.38 
 
 		 137 aa  130  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2936  heat shock protein Hsp20  44.2 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0011  heat shock protein IbpA  50.38 
 
 		 137 aa  130  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4143  heat shock protein IbpA  50.38 
 
 		 137 aa  130  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3020  heat shock protein Hsp20  42.66 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  40.29 
 
 		 145 aa  129  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0017  heat shock protein Hsp20  43.36 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4194  heat shock chaperone IbpB  43.36 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2117  heat shock protein Hsp20  45.26 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4051  heat shock chaperone IbpB  43.36 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0559  heat shock protein Hsp20  43.26 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5118  heat shock chaperone IbpB  43.36 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03513  hypothetical protein  43.36 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3898  heat shock chaperone IbpB  43.36 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0017  heat shock chaperone IbpB  43.36 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  48.15 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  41.84 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4233  heat shock chaperone IbpB  43.36 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  48.91 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4019  heat shock protein IbpA  47.06 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4636  heat shock protein Hsp20  43.45 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4198  heat shock protein IbpA  47.06 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4140  heat shock protein IbpA  47.06 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4036  heat shock protein IbpA  47.06 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4091  heat shock protein IbpA  47.06 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  41.01 
 
 		 145 aa  127  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03570  heat shock chaperone  48.55 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  48.55 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2715  heat shock protein Hsp20  43.38 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2014  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.918897  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03514  hypothetical protein  48.55 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  48.15 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0384  heat shock protein Hsp20  41.78 
 
 		 169 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  48.55 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  48.55 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  48.55 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  48.55 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2202  heat shock protein Hsp20  46.43 
 
 		 155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3877  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.446606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4052  heat shock protein IbpA  48.55 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>