239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0012 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0012  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3794  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.82162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4142  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0049  heat shock chaperone IbpB  91.24 
 
 		 142 aa  258  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.206343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0040  heat shock chaperone IbpB  76.97 
 
 		 150 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0035  heat shock chaperone IbpB  79.72 
 
 		 149 aa  240  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3913  heat shock chaperone IbpB  71.33 
 
 		 149 aa  221  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4104  heat shock chaperone IbpB  76.43 
 
 		 149 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0014  heat shock chaperone IbpB  68.89 
 
 		 142 aa  199  8e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4035  heat shock chaperone IbpB  64.63 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4139  heat shock chaperone IbpB  64.63 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4197  heat shock chaperone IbpB  64.63 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4018  heat shock chaperone IbpB  64.63 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4090  heat shock chaperone IbpB  64.63 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0017  heat shock protein Hsp20  62.22 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03513  hypothetical protein  62.22 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3898  heat shock chaperone IbpB  62.22 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5118  heat shock chaperone IbpB  62.22 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4051  heat shock chaperone IbpB  62.22 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4194  heat shock chaperone IbpB  62.22 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0017  heat shock chaperone IbpB  62.22 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4233  heat shock chaperone IbpB  62.69 
 
 		 142 aa  183  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03569  heat shock chaperone  60.8 
 
 		 133 aa  166  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3739  small heat shock protein  45.39 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  49.65 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  46.98 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  46.72 
 
 		 148 aa  140  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  47.14 
 
 		 146 aa  140  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  47.86 
 
 		 145 aa  140  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  46 
 
 		 156 aa  140  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4556  heat shock protein Hsp20  46 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  47.48 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0212  heat shock protein Hsp20  43.31 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5016  heat shock protein Hsp20  46 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  46.71 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  48.53 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  46.43 
 
 		 147 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  45.71 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2837  molecular chaperone (small heat shock protein)  45.91 
 
 		 160 aa  135  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00175036  normal  0.201531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  45.71 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  45.21 
 
 		 155 aa  135  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  45.71 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  45.71 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  45.71 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  45.71 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  45.71 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  45.71 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3321  heat shock protein Hsp20  42.77 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.945135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03570  heat shock chaperone  47.79 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  47.79 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5119  heat shock protein IbpA  47.79 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188059 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  47.79 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  47.79 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  47.79 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03514  hypothetical protein  47.79 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3620  heat shock protein Hsp20  42.77 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4052  heat shock protein IbpA  47.79 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  47.79 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2715  heat shock protein Hsp20  42.57 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3892  heat shock protein Hsp20  46.48 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  47.41 
 
 		 136 aa  134  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3914  heat shock protein IbpA  48.53 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  47.3 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  45.32 
 
 		 145 aa  134  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2892  putative small heat shock (HSP20) protein  46.21 
 
 		 152 aa  133  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00328323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0695  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 		 153 aa  133  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4091  heat shock protein IbpA  47.06 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4140  heat shock protein IbpA  47.06 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4198  heat shock protein IbpA  47.06 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1016  small heat shock protein  46.04 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.127734  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  45.32 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0763  heat shock protein Hsp20  42.11 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.50457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4019  heat shock protein IbpA  47.06 
 
 		 137 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4036  heat shock protein IbpA  47.06 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0011  heat shock protein IbpA  47.79 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4143  heat shock protein IbpA  47.79 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2891  heat shock protein Hsp20  45.83 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.457656  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3795  heat shock protein IbpA  47.79 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1373  small heat shock protein  45 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.272184 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0034  heat shock protein IbpA  48.53 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0039  heat shock protein IbpA  48.53 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0559  heat shock protein Hsp20  44.52 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0872  heat shock protein Hsp20  41.29 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.790875 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2676  heat shock protein Hsp20  45.32 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.983147  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  45.99 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2821  heat shock protein Hsp20  45.21 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13645  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  45.39 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  44.93 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2505  heat shock protein Hsp20  46.04 
 
 		 153 aa  130  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  44.93 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4263  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135314 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1600  aminodeoxychorismate lyase  44.29 
 
 		 169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000328737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2213  heat shock protein Hsp20  48.2 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4630  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2952  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1531  heat shock protein Hsp20  45.07 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280611  normal  0.217499 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3020  heat shock protein Hsp20  45.14 
 
 		 165 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>