214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2505 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2505  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
153 aa  306  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167107  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2202  heat shock protein Hsp20  72.9 
 
 
155 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0433  heat shock protein Hsp20  68.12 
 
 
164 aa  200  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2213  heat shock protein Hsp20  64.29 
 
 
157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  65.22 
 
 
160 aa  190  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  65.22 
 
 
160 aa  190  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4119  heat shock protein Hsp20  63.77 
 
 
160 aa  190  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336611  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4630  heat shock protein Hsp20  60.26 
 
 
162 aa  183  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127451  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4263  heat shock protein Hsp20  60.26 
 
 
167 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135314 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4636  heat shock protein Hsp20  54.48 
 
 
158 aa  168  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1373  small heat shock protein  52.6 
 
 
159 aa  167  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.272184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  56.43 
 
 
146 aa  166  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  57.45 
 
 
147 aa  165  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5227  heat shock protein Hsp20  52.6 
 
 
158 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0487576  normal  0.385827 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  55.71 
 
 
145 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  55.4 
 
 
147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  55.71 
 
 
147 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  55 
 
 
147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  55 
 
 
147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  55 
 
 
147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  55 
 
 
147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  55 
 
 
147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  55 
 
 
147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  55 
 
 
147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  53.85 
 
 
148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  55 
 
 
147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4626  heat shock protein Hsp20  52.94 
 
 
159 aa  161  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3145  heat shock protein Hsp20  53.06 
 
 
182 aa  160  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  52.9 
 
 
145 aa  161  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  53.62 
 
 
145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  54.29 
 
 
146 aa  158  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1531  heat shock protein Hsp20  53.74 
 
 
156 aa  157  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280611  normal  0.217499 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  54.55 
 
 
148 aa  157  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1139  heat shock protein Hsp20  50.32 
 
 
153 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  50 
 
 
145 aa  154  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2746  heat shock protein Hsp20  49.02 
 
 
168 aa  154  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145564  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2936  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
150 aa  153  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1668  small heat shock protein IbpA (16 kDa heat shock protein A)  50.72 
 
 
139 aa  153  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  53.85 
 
 
150 aa  153  8e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0695  heat shock protein Hsp20  53.19 
 
 
153 aa  153  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  53.64 
 
 
160 aa  152  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0763  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
158 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.50457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0212  heat shock protein Hsp20  54.68 
 
 
158 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3816  heat shock protein Hsp20  48.99 
 
 
158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0957  heat shock protein Hsp20  48.61 
 
 
158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.634441  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2961  small heat shock protein  50 
 
 
144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3020  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2952  heat shock protein Hsp20  47.74 
 
 
153 aa  150  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2891  heat shock protein Hsp20  48.95 
 
 
154 aa  150  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.457656  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3877  heat shock protein Hsp20  53.85 
 
 
159 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.446606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0872  heat shock protein Hsp20  48.3 
 
 
159 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.790875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0034  heat shock protein IbpA  50.36 
 
 
137 aa  148  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0559  heat shock protein Hsp20  46.75 
 
 
154 aa  148  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0039  heat shock protein IbpA  50.36 
 
 
137 aa  148  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  53.52 
 
 
154 aa  148  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1016  small heat shock protein  53.96 
 
 
158 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.127734  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2676  heat shock protein Hsp20  53.96 
 
 
158 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.983147  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
155 aa  147  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2821  heat shock protein Hsp20  50.65 
 
 
161 aa  147  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13645  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0384  heat shock protein Hsp20  53.19 
 
 
169 aa  147  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502047  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4533  heat shock protein Hsp20  48.95 
 
 
158 aa  146  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3739  small heat shock protein  48.34 
 
 
155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1754  heat shock protein Hsp20  46.45 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.19811  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5555  heat shock protein Hsp20  49.66 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3321  heat shock protein Hsp20  49.33 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2117  heat shock protein Hsp20  49.64 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5641  heat shock protein Hsp20  51.08 
 
 
157 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.41012  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  50.64 
 
 
156 aa  144  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4311  heat shock protein Hsp20  49.65 
 
 
153 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4551  heat shock protein Hsp20  49.65 
 
 
153 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.448918  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4105  heat shock protein IbpA  49.64 
 
 
137 aa  144  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3620  heat shock protein Hsp20  48.67 
 
 
156 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3036  small heat shock protein, HSP20-like chaperone  50 
 
 
149 aa  143  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0929913  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0011  heat shock protein IbpA  48.91 
 
 
137 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  50.7 
 
 
155 aa  142  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2715  heat shock protein Hsp20  47.71 
 
 
153 aa  142  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298562  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4143  heat shock protein IbpA  48.91 
 
 
137 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3795  heat shock protein IbpA  48.91 
 
 
137 aa  142  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3914  heat shock protein IbpA  48.91 
 
 
137 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  49.64 
 
 
137 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6473  heat shock protein Hsp20  47.55 
 
 
156 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436794  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2073  heat shock protein Hsp20  48.61 
 
 
159 aa  141  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1322  normal  0.515906 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2830  heat shock protein Hsp20  51.61 
 
 
152 aa  141  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0456781 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2014  heat shock protein Hsp20  50.72 
 
 
153 aa  140  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.918897  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2892  putative small heat shock (HSP20) protein  48.28 
 
 
152 aa  140  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00328323  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0614  Hsp20/alpha crystallin family protein  48.28 
 
 
154 aa  140  7e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300096  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0051  16 kDa heat shock protein A  47.33 
 
 
156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  49.29 
 
 
156 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5016  heat shock protein Hsp20  49.29 
 
 
156 aa  137  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4556  heat shock protein Hsp20  49.29 
 
 
156 aa  137  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3510  heat shock protein Hsp20  48.95 
 
 
170 aa  136  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.420499  normal  0.371318 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2501  heat shock protein Hsp20  48.95 
 
 
158 aa  135  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4279  heat shock protein Hsp20  47.3 
 
 
156 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1883  heat shock protein Hsp20  48.55 
 
 
147 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2837  molecular chaperone (small heat shock protein)  44.44 
 
 
160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00175036  normal  0.201531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1214  heat shock protein Hsp20  49.65 
 
 
155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.602847 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02239  small heat shock protein  45.14 
 
 
151 aa  134  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0040  heat shock chaperone IbpB  46.71 
 
 
150 aa  134  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1980  heat shock protein Hsp20  47.41 
 
 
147 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168332  normal  0.0400891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>