More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1348 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0160  ISSep1-like transposase  99.49 
 
 
337 aa  409  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0260  ISSep1-like transposase  99.49 
 
 
337 aa  409  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0380  ISSep1-like transposase  99.49 
 
 
337 aa  409  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0558  ISSep1-like transposase  99.49 
 
 
337 aa  409  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0565  ISSep1-like transposase  98.99 
 
 
337 aa  407  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0577  ISSep1-like transposase  99.49 
 
 
337 aa  409  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.388646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0697  ISSep1-like transposase  99.49 
 
 
337 aa  409  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0991  ISSep1-like transposase  99.49 
 
 
337 aa  409  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1348  ISSep1-like transposase  100 
 
 
198 aa  409  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.711831  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1730  ISSep1-like transposase  99.49 
 
 
337 aa  409  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000971497  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1911  ISSep1-like transposase  98.99 
 
 
337 aa  407  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0544  ISSep1-like transposase  98.48 
 
 
337 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.33 
 
 
402 aa  86.7  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000872071  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0488  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.47 
 
 
433 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000137882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0814  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.47 
 
 
433 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00371841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3315  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.47 
 
 
433 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.579778  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1615  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.43 
 
 
419 aa  75.5  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.43 
 
 
419 aa  75.5  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.43 
 
 
419 aa  75.5  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.43 
 
 
419 aa  75.5  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.43 
 
 
419 aa  75.5  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.862499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1550  transposase IS116/IS110/IS902  31.98 
 
 
429 aa  74.7  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2770  transposase IS116/IS110/IS902  31.98 
 
 
429 aa  74.7  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1884  transposase IS116/IS110/IS902  35.04 
 
 
429 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2484  transposase IS116/IS110/IS902  35.04 
 
 
429 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  27.78 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  27.78 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  29.22 
 
 
414 aa  72.4  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0963  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.95 
 
 
427 aa  72.4  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.95 
 
 
427 aa  72.4  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 
420 aa  72  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0527  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 
420 aa  72  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1515  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 
420 aa  72  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0644  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 
420 aa  72  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1950  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 
420 aa  72  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 
420 aa  72  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1259  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 
420 aa  72  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1045  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 
420 aa  72  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1558  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 
420 aa  72  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000508366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0076  transposase  29.82 
 
 
416 aa  71.2  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0574948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0577  putative transposase  29.82 
 
 
416 aa  71.2  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0549  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.84 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000582455  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.48 
 
 
393 aa  69.3  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0349  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.53 
 
 
427 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.248005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0850  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.53 
 
 
427 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.884754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0857  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.53 
 
 
427 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1351  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.53 
 
 
427 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000796647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.53 
 
 
427 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1826  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.28 
 
 
427 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.508781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2015  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.53 
 
 
427 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.792556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2829  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.53 
 
 
427 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3473  hypothetical protein  24.54 
 
 
403 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0880625 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3962  hypothetical protein  24.54 
 
 
403 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.462715  normal  0.0823882 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1828  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.54 
 
 
403 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1800  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.54 
 
 
427 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3558  hypothetical protein  24.54 
 
 
403 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3521  hypothetical protein  24.54 
 
 
403 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880505 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0729  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.54 
 
 
427 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.876532 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1925  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.94 
 
 
427 aa  68.6  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2586  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.94 
 
 
427 aa  68.6  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2749  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.33 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  26.29 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1544  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.73 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00314291  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2146  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.4 
 
 
427 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.4 
 
 
427 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0266  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.94 
 
 
425 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.4 
 
 
427 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.65 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1224  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.65 
 
 
328 aa  65.5  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000744849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.65 
 
 
328 aa  65.5  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0033  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.89 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.358134  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10850  transposase  27.71 
 
 
405 aa  65.1  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.480792  unclonable  0.00000000306123 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0806  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30 
 
 
355 aa  65.1  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.268698  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1556  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.75 
 
 
328 aa  63.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00019648  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.07 
 
 
328 aa  64.3  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1895  ISAfe1, transposase  25 
 
 
342 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4628  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.6 
 
 
420 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2913  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.62 
 
 
339 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1569  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 
342 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196029 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 
342 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2781  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 
342 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3183  ISAfe1, transposase  25 
 
 
342 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487441  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1250  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28 
 
 
428 aa  64.3  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0325438  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0408  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.63 
 
 
326 aa  63.2  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000108361  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1120  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.75 
 
 
328 aa  63.2  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0932183  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  23.16 
 
 
343 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  24.74 
 
 
343 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  24.74 
 
 
343 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  24.74 
 
 
343 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  24.74 
 
 
343 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  24.74 
 
 
343 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  24.74 
 
 
343 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  24.74 
 
 
343 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.3 
 
 
344 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0894966  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.01 
 
 
346 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0087  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.35 
 
 
411 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.35 
 
 
411 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.156044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1454  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.35 
 
 
411 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1624  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.35 
 
 
411 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1909  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.35 
 
 
411 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>