More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0558 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0160  ISSep1-like transposase  99.7 
 
 
337 aa  698    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0260  ISSep1-like transposase  99.7 
 
 
337 aa  698    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0380  ISSep1-like transposase  99.7 
 
 
337 aa  698    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0544  ISSep1-like transposase  99.41 
 
 
337 aa  697    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0558  ISSep1-like transposase  100 
 
 
337 aa  700    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0565  ISSep1-like transposase  99.41 
 
 
337 aa  696    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0577  ISSep1-like transposase  99.7 
 
 
337 aa  698    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.388646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0697  ISSep1-like transposase  99.41 
 
 
337 aa  695    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0991  ISSep1-like transposase  99.7 
 
 
337 aa  698    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1730  ISSep1-like transposase  99.7 
 
 
337 aa  698    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000971497  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1911  ISSep1-like transposase  99.41 
 
 
337 aa  696    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1348  ISSep1-like transposase  99.49 
 
 
198 aa  409  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.711831  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1340  ISSep1-like transposase  95.31 
 
 
158 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.172257  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3315  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.5 
 
 
433 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.579778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0814  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.5 
 
 
433 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00371841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0488  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.5 
 
 
433 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000137882  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.74 
 
 
402 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000872071  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  26.05 
 
 
406 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  26.05 
 
 
406 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1550  transposase IS116/IS110/IS902  27.62 
 
 
429 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2770  transposase IS116/IS110/IS902  27.62 
 
 
429 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1884  transposase IS116/IS110/IS902  27.62 
 
 
429 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2484  transposase IS116/IS110/IS902  27.62 
 
 
429 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.88 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.83 
 
 
427 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0963  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.83 
 
 
427 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0349  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.15 
 
 
427 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.248005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0850  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.15 
 
 
427 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.884754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0857  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.15 
 
 
427 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1351  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.15 
 
 
427 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000796647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.15 
 
 
427 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1826  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.15 
 
 
427 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.508781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2015  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.15 
 
 
427 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.792556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2829  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.15 
 
 
427 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10850  transposase  25.15 
 
 
405 aa  85.9  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.480792  unclonable  0.00000000306123 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1615  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.32 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.32 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.862499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.32 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.32 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1925  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.61 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2586  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.61 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.13 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.01 
 
 
419 aa  82.8  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.04 
 
 
404 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.61 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2146  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.61 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.61 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0549  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.83 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000582455  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1950  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.6 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1558  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.6 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000508366  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1515  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.6 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.6 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.6 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1259  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.6 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0527  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.6 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0644  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.6 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1045  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.6 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3473  hypothetical protein  24.08 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0880625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1828  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.08 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3558  hypothetical protein  24.08 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3521  hypothetical protein  24.08 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880505 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3962  hypothetical protein  24.08 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.462715  normal  0.0823882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0266  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.18 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1800  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.08 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2193  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.67 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107732 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0729  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.08 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.876532 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3682  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.67 
 
 
408 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0868  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.67 
 
 
408 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0776051 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1574  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.67 
 
 
408 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2497  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.67 
 
 
408 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.164831  normal  0.0212022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.67 
 
 
408 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0845  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.67 
 
 
408 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.64 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1194  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.22 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000290611  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0251  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.22 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0729  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.22 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0040  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.22 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.268434  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1360  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.22 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000458925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1544  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.59 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00314291  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  26.73 
 
 
414 aa  72.8  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0087  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.21 
 
 
411 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.21 
 
 
411 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.156044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1454  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.21 
 
 
411 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1624  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.21 
 
 
411 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1909  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.21 
 
 
411 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122556  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4628  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.45 
 
 
420 aa  72.4  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  24.17 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1250  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.77 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0325438  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0076  transposase  29.82 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0574948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0577  putative transposase  29.82 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.27 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2223  transposase, IS110 family, OrfA  23.19 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92844e-48 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1635  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.04 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1353  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.04 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  26.6 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1971  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.08 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0214009  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0033  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.28 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.358134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3066  transposase  23.19 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000892616  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2151  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.76 
 
 
427 aa  66.2  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1318  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.76 
 
 
427 aa  66.2  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.141611  normal  0.0459431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>