More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0697 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0160  ISSep1-like transposase  99.7 
 
 
337 aa  697    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0260  ISSep1-like transposase  99.7 
 
 
337 aa  697    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0380  ISSep1-like transposase  99.7 
 
 
337 aa  697    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0544  ISSep1-like transposase  98.81 
 
 
337 aa  693    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0558  ISSep1-like transposase  99.41 
 
 
337 aa  695    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0565  ISSep1-like transposase  99.41 
 
 
337 aa  696    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0577  ISSep1-like transposase  99.7 
 
 
337 aa  697    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.388646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0697  ISSep1-like transposase  100 
 
 
337 aa  700    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0991  ISSep1-like transposase  99.7 
 
 
337 aa  697    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1730  ISSep1-like transposase  99.7 
 
 
337 aa  697    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000971497  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1911  ISSep1-like transposase  99.41 
 
 
337 aa  696    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1348  ISSep1-like transposase  99.49 
 
 
198 aa  409  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.711831  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1340  ISSep1-like transposase  95.31 
 
 
158 aa  253  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.172257  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0814  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.5 
 
 
433 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00371841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0488  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.5 
 
 
433 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000137882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3315  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.5 
 
 
433 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.579778  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
402 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000872071  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  26.05 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  26.05 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1550  transposase IS116/IS110/IS902  27.54 
 
 
429 aa  93.2  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2770  transposase IS116/IS110/IS902  27.54 
 
 
429 aa  93.2  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.1 
 
 
393 aa  93.2  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1884  transposase IS116/IS110/IS902  27.54 
 
 
429 aa  92.4  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2484  transposase IS116/IS110/IS902  27.54 
 
 
429 aa  92.4  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.14 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0963  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.14 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10850  transposase  24.85 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.480792  unclonable  0.00000000306123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0349  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.55 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.248005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0850  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.55 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.884754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0857  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.55 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1351  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.55 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000796647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.55 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1826  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.55 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.508781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2015  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.55 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.792556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2829  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.55 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.01 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.862499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.01 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.01 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1615  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.01 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2586  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.54 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1925  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.54 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.81 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.54 
 
 
427 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2146  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.54 
 
 
427 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.54 
 
 
427 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.63 
 
 
404 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.71 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1515  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.3 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1950  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.3 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.3 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0644  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.3 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0527  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.3 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1045  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.3 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1259  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.3 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.3 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1558  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.3 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000508366  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0549  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.5 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000582455  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0266  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  21.8 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0729  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.22 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0040  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.22 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.268434  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0251  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.22 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3962  hypothetical protein  23.67 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.462715  normal  0.0823882 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3558  hypothetical protein  23.67 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3521  hypothetical protein  23.67 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880505 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1194  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.22 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000290611  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1360  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.22 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000458925  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1828  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.67 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3473  hypothetical protein  23.67 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0880625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0729  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.67 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.876532 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1800  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.67 
 
 
427 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2193  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.36 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107732 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1574  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.36 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.36 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2497  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.36 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.164831  normal  0.0212022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3682  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.36 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0845  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.36 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0868  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.36 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0776051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  26.73 
 
 
414 aa  72.8  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.28 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0076  transposase  29.82 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0574948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0577  putative transposase  29.82 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1544  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.26 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00314291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0087  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.84 
 
 
411 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.84 
 
 
411 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.156044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1454  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.84 
 
 
411 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1624  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.84 
 
 
411 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1909  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.84 
 
 
411 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122556  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4628  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.09 
 
 
420 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  23.08 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1353  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.81 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1635  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.81 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1250  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.46 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0325438  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  26.6 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0033  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.28 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.358134  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0806  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.09 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.268698  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.65 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1224  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.65 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000744849  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2223  transposase, IS110 family, OrfA  22.83 
 
 
412 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92844e-48 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.04 
 
 
403 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1556  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.07 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00019648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>