95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1865 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 254 aa  511  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.36 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.18 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.06 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.67 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.32 
 
 		 212 aa  141  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.81 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.81 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.81 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.67 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.71 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.71 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.71 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.33 
 
 		 147 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  39.77 
 
 		 200 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4709  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.07 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.47 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  37.13 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  34.01 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4922  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.73 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4318  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.33 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.531167  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.36 
 
 		 225 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.91 
 
 		 198 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.73 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4237  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.5 
 
 		 469 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.94 
 
 		 241 aa  102  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.76 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.89 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5312  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.05 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3967  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.5 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 		 185 aa  89.4  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  31.25 
 
 		 1027 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  28.09 
 
 		 208 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5697  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.76 
 
 		 400 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407946 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  27.12 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5832  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.25 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671661  hitchhiker  0.00379539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  28.75 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0646  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.88 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3140  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.83 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0169757  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.58 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.14 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2945  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.28 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0435616  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.77 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.32 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.62 
 
 		 153 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.59 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.28 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  23.38 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.71 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.61 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.14 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3792  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding:carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.57 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100636  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  28.48 
 
 		 983 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  26.49 
 
 		 241 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.32 
 
 		 246 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.48 
 
 		 181 aa  52.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.32 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.7 
 
 		 176 aa  52  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.13 
 
 		 139 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.548712  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  26.62 
 
 		 1011 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  26.62 
 
 		 1011 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.7 
 
 		 178 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  24.55 
 
 		 176 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  23.7 
 
 		 176 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 		 156 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0478  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.33 
 
 		 145 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.49685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.05 
 
 		 155 aa  48.9  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.63 
 
 		 154 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.67 
 
 		 202 aa  48.5  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.2 
 
 		 158 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.04 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.2 
 
 		 158 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4550  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.92 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  24.65 
 
 		 1012 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.03 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.26 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  25.33 
 
 		 980 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.3 
 
 		 149 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.03 
 
 		 154 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  25.79 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.86 
 
 		 154 aa  46.6  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.58 
 
 		 148 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.48 
 
 		 208 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  28.47 
 
 		 988 aa  45.8  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  22.44 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.69 
 
 		 145 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.304231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.97 
 
 		 151 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  28.99 
 
 		 997 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.62 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.6 
 
 		 151 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4415  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.68 
 
 		 150 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.43 
 
 		 193 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.15 
 
 		 151 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  23.61 
 
 		 150 aa  42  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>