131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2608 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
148 aa  296  6e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  83.11 
 
 
148 aa  248  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  77.7 
 
 
148 aa  244  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  80.41 
 
 
154 aa  239  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  77.85 
 
 
153 aa  234  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  77.55 
 
 
151 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  76.35 
 
 
155 aa  228  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  72.11 
 
 
147 aa  215  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  68.46 
 
 
154 aa  200  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  66.44 
 
 
154 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  64.08 
 
 
213 aa  187  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  61.22 
 
 
216 aa  184  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58.9 
 
 
152 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  57.82 
 
 
155 aa  165  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58 
 
 
156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  55.32 
 
 
161 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  55.32 
 
 
158 aa  159  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  53.9 
 
 
157 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.37 
 
 
178 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  50 
 
 
176 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50 
 
 
176 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.43 
 
 
197 aa  148  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.65 
 
 
204 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.33 
 
 
243 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.22 
 
 
151 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.97 
 
 
202 aa  147  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.83 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  53.9 
 
 
158 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  47.18 
 
 
150 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  53.9 
 
 
158 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  46.48 
 
 
150 aa  140  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.62 
 
 
198 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  47.52 
 
 
232 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.28 
 
 
152 aa  137  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  47.55 
 
 
213 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.83 
 
 
246 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.75 
 
 
182 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.14 
 
 
187 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.28 
 
 
224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.58 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.28 
 
 
224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.37 
 
 
151 aa  122  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.55 
 
 
241 aa  120  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.6 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.97 
 
 
249 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.62 
 
 
269 aa  114  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  50.68 
 
 
176 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.43 
 
 
181 aa  110  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  38.46 
 
 
1011 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  38.1 
 
 
1011 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  36.36 
 
 
1012 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  38.03 
 
 
997 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  36.73 
 
 
980 aa  97.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.67 
 
 
987 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.5 
 
 
152 aa  97.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688113  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.41 
 
 
1012 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6673  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.59 
 
 
1019 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581747  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  34.72 
 
 
983 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  36.73 
 
 
221 aa  89.4  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  36.62 
 
 
991 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.09 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1301  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  38.02 
 
 
988 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.648743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.51 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2227  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.28 
 
 
229 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.07 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  32.17 
 
 
988 aa  78.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.61 
 
 
223 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.11 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  27.39 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.95 
 
 
253 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5354  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.93 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  30.88 
 
 
208 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.61 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.17 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.39 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  29.41 
 
 
206 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.63 
 
 
237 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.35 
 
 
154 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0678  hypothetical protein  26.38 
 
 
242 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.22 
 
 
150 aa  60.5  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1016  hypothetical protein  26.09 
 
 
242 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0608  carbon monoxide dehydrogenase family protein  26.09 
 
 
242 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.802203  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2442  carbon monoxide dehydrogenase family protein  26.09 
 
 
242 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0851  carbon monoxide dehydrogenase family protein  26.09 
 
 
242 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0856  carbon monoxide dehydrogenase family protein  26.09 
 
 
242 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0056  carbon monoxide dehydrogenase family protein  26.09 
 
 
242 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.17 
 
 
251 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.32 
 
 
208 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.61 
 
 
254 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.35 
 
 
241 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.16 
 
 
212 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  25.19 
 
 
1027 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0685  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.56 
 
 
235 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.31708 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  30.61 
 
 
262 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 
244 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.2 
 
 
225 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.7 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 
241 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.34 
 
 
240 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>