136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1748 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
154 aa  310  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  93.46 
 
 
154 aa  292  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  69.13 
 
 
148 aa  201  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  68.46 
 
 
148 aa  200  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  65.81 
 
 
154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  66.67 
 
 
155 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  66 
 
 
153 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  64.86 
 
 
151 aa  187  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  64.86 
 
 
147 aa  184  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  61.07 
 
 
148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  59.31 
 
 
213 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58.04 
 
 
216 aa  171  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  54.42 
 
 
152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  56.08 
 
 
155 aa  160  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.97 
 
 
198 aa  158  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.97 
 
 
193 aa  157  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.95 
 
 
204 aa  156  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  53.85 
 
 
182 aa  155  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.97 
 
 
197 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.35 
 
 
156 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  52.48 
 
 
232 aa  154  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  51.39 
 
 
213 aa  153  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.33 
 
 
158 aa  153  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.74 
 
 
187 aa  152  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.7 
 
 
202 aa  150  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.66 
 
 
157 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.97 
 
 
243 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.66 
 
 
224 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.66 
 
 
224 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.34 
 
 
178 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.41 
 
 
158 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.41 
 
 
158 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.26 
 
 
246 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  50.34 
 
 
176 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.34 
 
 
176 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  46.15 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  46.15 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  46.62 
 
 
161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.07 
 
 
151 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.45 
 
 
151 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.38 
 
 
152 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  54.67 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.94 
 
 
208 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  39.86 
 
 
980 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.78 
 
 
269 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  39.74 
 
 
1011 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  39.74 
 
 
1011 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  39.19 
 
 
1012 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.5 
 
 
241 aa  110  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  37.75 
 
 
1012 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.55 
 
 
249 aa  107  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.89 
 
 
151 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.5 
 
 
220 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6673  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  39.44 
 
 
1019 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581747  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  53.62 
 
 
181 aa  103  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  38.51 
 
 
987 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  37.67 
 
 
997 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.57 
 
 
152 aa  94  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688113  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2227  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.55 
 
 
229 aa  92.8  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  37.68 
 
 
221 aa  91.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.53 
 
 
222 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  38.46 
 
 
991 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  34.03 
 
 
983 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1301  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  40.16 
 
 
988 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.648743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.68 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5354  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.47 
 
 
204 aa  77  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.85 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.87 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  32.43 
 
 
988 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.14 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1492  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.33 
 
 
216 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.619524  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  27.89 
 
 
1027 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  31.76 
 
 
200 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  25.83 
 
 
208 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.88 
 
 
248 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.38 
 
 
253 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.92 
 
 
254 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1016  hypothetical protein  25.45 
 
 
242 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0678  hypothetical protein  25.45 
 
 
242 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0608  carbon monoxide dehydrogenase family protein  25.45 
 
 
242 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.802203  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2442  carbon monoxide dehydrogenase family protein  25.45 
 
 
242 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0851  carbon monoxide dehydrogenase family protein  25.45 
 
 
242 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0856  carbon monoxide dehydrogenase family protein  25.45 
 
 
242 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0056  carbon monoxide dehydrogenase family protein  25.45 
 
 
242 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.17 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.14 
 
 
149 aa  60.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.89 
 
 
208 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  26.32 
 
 
253 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0569  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.47 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0217411 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  28.08 
 
 
206 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  27.39 
 
 
289 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  29.41 
 
 
241 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.01 
 
 
225 aa  57.4  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.37 
 
 
306 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.79 
 
 
237 aa  56.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.05 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.8 
 
 
237 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28 
 
 
222 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28 
 
 
222 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>