64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0474 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
248 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  64.31 
 
 
253 aa  322  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  64.71 
 
 
253 aa  319  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0856  carbon monoxide dehydrogenase family protein  65.86 
 
 
242 aa  308  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229511  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0608  carbon monoxide dehydrogenase family protein  65.86 
 
 
242 aa  308  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.802203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0851  carbon monoxide dehydrogenase family protein  65.86 
 
 
242 aa  308  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1016  hypothetical protein  65.86 
 
 
242 aa  308  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0678  hypothetical protein  66.67 
 
 
242 aa  308  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0056  carbon monoxide dehydrogenase family protein  65.86 
 
 
242 aa  308  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2442  carbon monoxide dehydrogenase family protein  65.86 
 
 
242 aa  308  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2003  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58.87 
 
 
235 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2613  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58.87 
 
 
235 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58.47 
 
 
235 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2660  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  60.98 
 
 
235 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2533  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  60.98 
 
 
235 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5944  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  56.85 
 
 
235 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.163492 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0685  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  57.43 
 
 
235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.31708 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.39 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.68 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 
198 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  28.57 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  30.91 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.26 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.56 
 
 
193 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.12 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.4 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.19 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.38 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.54 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.39 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.68 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.45 
 
 
151 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.88 
 
 
154 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  29.33 
 
 
148 aa  62  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.14 
 
 
156 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.92 
 
 
216 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  25.97 
 
 
150 aa  60.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  25.97 
 
 
150 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.2 
 
 
147 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.03 
 
 
178 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.34 
 
 
176 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.66 
 
 
155 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.61 
 
 
151 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.17 
 
 
152 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  28.66 
 
 
176 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.83 
 
 
153 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.61 
 
 
154 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.61 
 
 
151 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.34 
 
 
152 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.92 
 
 
158 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.5 
 
 
202 aa  53.1  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  24.07 
 
 
161 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.62 
 
 
157 aa  52  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  30.28 
 
 
983 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.53 
 
 
148 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.38 
 
 
151 aa  50.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.63 
 
 
155 aa  48.5  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.01 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.32 
 
 
220 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  24.28 
 
 
176 aa  45.4  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 
158 aa  42.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 
158 aa  42.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  23.36 
 
 
221 aa  42  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>