138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5319 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  100 
 
 
148 aa  296  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  87.16 
 
 
154 aa  263  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  85.91 
 
 
153 aa  262  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  85.03 
 
 
151 aa  257  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  83.78 
 
 
155 aa  254  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  83.11 
 
 
148 aa  248  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  77.55 
 
 
147 aa  230  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  71.62 
 
 
148 aa  224  4e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  69.13 
 
 
154 aa  201  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  67.11 
 
 
154 aa  197  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  66.2 
 
 
213 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  65.03 
 
 
216 aa  194  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58.67 
 
 
156 aa  175  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58.22 
 
 
152 aa  175  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  60.54 
 
 
155 aa  174  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  56.74 
 
 
161 aa  161  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.05 
 
 
178 aa  159  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.37 
 
 
176 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  51.37 
 
 
176 aa  156  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  54.61 
 
 
157 aa  156  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.31 
 
 
151 aa  156  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.3 
 
 
204 aa  156  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  53.9 
 
 
158 aa  156  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.92 
 
 
151 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.34 
 
 
197 aa  153  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.33 
 
 
243 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  48.95 
 
 
150 aa  150  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  48.95 
 
 
150 aa  150  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.3 
 
 
202 aa  147  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.61 
 
 
187 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  56.74 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  56.74 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  48.23 
 
 
232 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50 
 
 
193 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.62 
 
 
198 aa  143  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.45 
 
 
152 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  48.95 
 
 
213 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.14 
 
 
182 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.21 
 
 
246 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.28 
 
 
224 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.28 
 
 
224 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52 
 
 
208 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  56.43 
 
 
181 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  53.42 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.37 
 
 
151 aa  120  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.44 
 
 
241 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.19 
 
 
249 aa  114  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.62 
 
 
269 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  39.86 
 
 
1011 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  39.86 
 
 
1011 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  40.85 
 
 
997 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.96 
 
 
152 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688113  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  36.73 
 
 
1012 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  35.66 
 
 
1012 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  36.05 
 
 
980 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6673  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.59 
 
 
1019 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581747  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  39.04 
 
 
987 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  33.57 
 
 
983 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  38.73 
 
 
991 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  36.23 
 
 
221 aa  88.6  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.47 
 
 
185 aa  87.8  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1301  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  40.5 
 
 
988 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.648743 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  37.06 
 
 
988 aa  85.1  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.23 
 
 
222 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.96 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.03 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2227  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.12 
 
 
229 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  31.85 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.93 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.85 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.83 
 
 
254 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.32 
 
 
225 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.86 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.81 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  27.33 
 
 
1027 aa  67  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.67 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  29.63 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.53 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1492  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.67 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.619524  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5354  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.39 
 
 
204 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.78 
 
 
241 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.57 
 
 
253 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.63 
 
 
237 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.85 
 
 
306 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.33 
 
 
248 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.17 
 
 
212 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  25.48 
 
 
253 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.38 
 
 
254 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.1 
 
 
244 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.7 
 
 
237 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  31.47 
 
 
200 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.9 
 
 
147 aa  58.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.45 
 
 
251 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  28.57 
 
 
289 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.41 
 
 
241 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.53 
 
 
234 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  31.17 
 
 
241 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.38 
 
 
240 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.38 
 
 
240 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.38 
 
 
240 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.990283 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>