119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4535 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
202 aa  413  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  67.47 
 
 
197 aa  234  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  67.95 
 
 
243 aa  227  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  63.06 
 
 
204 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  55.94 
 
 
232 aa  174  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.1 
 
 
198 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  53.74 
 
 
193 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  45.12 
 
 
213 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  55.24 
 
 
182 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  55.32 
 
 
187 aa  164  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.59 
 
 
224 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52 
 
 
224 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.7 
 
 
154 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  47.3 
 
 
148 aa  147  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.97 
 
 
148 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.66 
 
 
147 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.65 
 
 
148 aa  146  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.1 
 
 
154 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.62 
 
 
213 aa  143  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.65 
 
 
155 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.3 
 
 
154 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.38 
 
 
216 aa  141  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.31 
 
 
153 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.64 
 
 
151 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.26 
 
 
158 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.33 
 
 
155 aa  137  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.36 
 
 
152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.75 
 
 
156 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.87 
 
 
178 aa  131  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.54 
 
 
157 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.87 
 
 
176 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  38.73 
 
 
176 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.44 
 
 
158 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.44 
 
 
158 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  39.46 
 
 
161 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.02 
 
 
269 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.58 
 
 
151 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.89 
 
 
151 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.9 
 
 
208 aa  115  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  37.86 
 
 
150 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  37.86 
 
 
150 aa  112  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  43.92 
 
 
176 aa  107  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.71 
 
 
152 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.84 
 
 
246 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.36 
 
 
181 aa  97.8  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.22 
 
 
151 aa  95.1  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.56 
 
 
241 aa  94.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.6 
 
 
249 aa  92  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.45 
 
 
152 aa  91.7  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688113  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.79 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  34.03 
 
 
997 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  33.11 
 
 
983 aa  84.7  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  34.48 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  31.25 
 
 
1011 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.42 
 
 
987 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  31.25 
 
 
1011 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  31.58 
 
 
1012 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1301  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  38.58 
 
 
988 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.648743 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  31.91 
 
 
980 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2227  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.29 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  31.91 
 
 
1012 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6673  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.32 
 
 
1019 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581747  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  28.86 
 
 
1027 aa  71.6  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.75 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5354  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.05 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.86 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  32.28 
 
 
991 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.33 
 
 
141 aa  64.3  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  22.5 
 
 
253 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.12 
 
 
253 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.32 
 
 
150 aa  61.6  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  29.29 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.36 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1492  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.4 
 
 
216 aa  58.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.619524  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  28.27 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 
147 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 
254 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  28.91 
 
 
988 aa  56.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.2 
 
 
153 aa  55.5  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0678  hypothetical protein  23.12 
 
 
242 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2003  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.33 
 
 
235 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2613  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.33 
 
 
235 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0875  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0407732  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1016  hypothetical protein  23.7 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0608  carbon monoxide dehydrogenase family protein  23.7 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.802203  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2442  carbon monoxide dehydrogenase family protein  23.7 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0851  carbon monoxide dehydrogenase family protein  23.7 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0856  carbon monoxide dehydrogenase family protein  23.7 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229511  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.37 
 
 
149 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0056  carbon monoxide dehydrogenase family protein  23.7 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5944  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24 
 
 
235 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.163492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.17 
 
 
208 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.5 
 
 
248 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.86 
 
 
251 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2660  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.64 
 
 
235 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2533  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.64 
 
 
235 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.67 
 
 
235 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.44 
 
 
225 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  26.28 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.46 
 
 
237 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>