52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5944 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5944  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
235 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.163492 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2003  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  91.06 
 
 
235 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210005  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  90.64 
 
 
235 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2613  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  91.06 
 
 
235 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2533  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  85.96 
 
 
235 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2660  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  85.96 
 
 
235 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1016  hypothetical protein  69.42 
 
 
242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0056  carbon monoxide dehydrogenase family protein  69.42 
 
 
242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0856  carbon monoxide dehydrogenase family protein  69.42 
 
 
242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0851  carbon monoxide dehydrogenase family protein  69.42 
 
 
242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2442  carbon monoxide dehydrogenase family protein  69.42 
 
 
242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0608  carbon monoxide dehydrogenase family protein  69.42 
 
 
242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.802203  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0678  hypothetical protein  69.01 
 
 
242 aa  334  7e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0685  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  75.32 
 
 
235 aa  316  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.31708 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  56.85 
 
 
248 aa  271  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  57.54 
 
 
253 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  55.56 
 
 
253 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30 
 
 
193 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.14 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.7 
 
 
187 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  26.35 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.83 
 
 
198 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.68 
 
 
243 aa  62.8  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  26.32 
 
 
213 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.15 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.15 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.08 
 
 
197 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.03 
 
 
213 aa  59.3  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.84 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.17 
 
 
156 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.62 
 
 
154 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.03 
 
 
154 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24 
 
 
202 aa  52.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.68 
 
 
148 aa  52  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.45 
 
 
178 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  23.87 
 
 
161 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  26.58 
 
 
148 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.97 
 
 
176 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  26.97 
 
 
176 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.17 
 
 
216 aa  49.3  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.38 
 
 
148 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.14 
 
 
151 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.18 
 
 
147 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.81 
 
 
155 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  23.78 
 
 
150 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.49 
 
 
151 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  26.24 
 
 
980 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.63 
 
 
151 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  23.08 
 
 
150 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.92 
 
 
152 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.7 
 
 
208 aa  42.7  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.35 
 
 
223 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>