93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0642 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 251 aa  487  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  50.52 
 
 		 289 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  44.66 
 
 		 262 aa  181  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4237  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  54.74 
 
 		 469 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4922  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  54.48 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4709  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.8 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.32 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  53.85 
 
 		 240 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  53.85 
 
 		 240 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  53.85 
 
 		 240 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.17 
 
 		 254 aa  155  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.72 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4318  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.2 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.531167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.3 
 
 		 147 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.84 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.97 
 
 		 244 aa  141  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5312  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.17 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.15 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.44 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.25 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.25 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.25 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3967  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40 
 
 		 246 aa  122  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  39.16 
 
 		 200 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.57 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.44 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.56 
 
 		 185 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.66 
 
 		 208 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.17 
 
 		 198 aa  99  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.76 
 
 		 241 aa  92.4  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.5 
 
 		 306 aa  92  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2945  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.9 
 
 		 182 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0435616  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  28.92 
 
 		 1027 aa  86.3  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.21 
 
 		 182 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3140  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.54 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0169757  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.62 
 
 		 405 aa  82  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3792  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding:carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.17 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  27.98 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  30.22 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5697  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.45 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0646  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4550  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.45 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  32.68 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.35 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.37 
 
 		 147 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.88 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.17 
 
 		 148 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  29.45 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.53 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5832  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  28.67 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671661  hitchhiker  0.00379539 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.33 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.95 
 
 		 158 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.32 
 
 		 154 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.29 
 
 		 202 aa  52.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 		 216 aa  52  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.67 
 
 		 246 aa  52  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.66 
 
 		 153 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.4 
 
 		 155 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.21 
 
 		 148 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.95 
 
 		 152 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.08 
 
 		 151 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.71 
 
 		 151 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8407  hypothetical protein  28.03 
 
 		 279 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 		 154 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.67 
 
 		 151 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  26.16 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.52 
 
 		 153 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  28.22 
 
 		 176 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.8 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.78 
 
 		 193 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 		 155 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.08 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.52 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.63 
 
 		 176 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.87 
 
 		 158 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.87 
 
 		 158 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.83 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.47 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.47 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.33 
 
 		 178 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.84 
 
 		 154 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.99 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.44 
 
 		 141 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  27.92 
 
 		 997 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4415  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.15 
 
 		 150 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.93 
 
 		 152 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.99 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  27.34 
 
 		 232 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.25 
 
 		 139 aa  42.7  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.548712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3913  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.7 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0164888  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  26.9 
 
 		 213 aa  42.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.273128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>