126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4327 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
154 aa  310  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  92.86 
 
 
153 aa  285  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  94.67 
 
 
151 aa  282  9e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  87.16 
 
 
155 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  87.16 
 
 
148 aa  263  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  80.41 
 
 
148 aa  239  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  73.15 
 
 
147 aa  227  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  70.95 
 
 
148 aa  219  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  65.81 
 
 
154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  63.64 
 
 
154 aa  193  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  62.5 
 
 
216 aa  185  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  60.84 
 
 
213 aa  180  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58.06 
 
 
156 aa  174  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  55.17 
 
 
152 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  56.38 
 
 
155 aa  163  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.37 
 
 
178 aa  156  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.68 
 
 
176 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  50 
 
 
176 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  50.34 
 
 
161 aa  150  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.31 
 
 
204 aa  150  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.34 
 
 
197 aa  149  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.41 
 
 
158 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.21 
 
 
151 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.7 
 
 
157 aa  147  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.03 
 
 
243 aa  147  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.83 
 
 
151 aa  146  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.1 
 
 
202 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.89 
 
 
187 aa  140  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.14 
 
 
182 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.41 
 
 
158 aa  138  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.41 
 
 
158 aa  138  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.58 
 
 
246 aa  137  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  45.14 
 
 
150 aa  137  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  45.14 
 
 
150 aa  136  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.36 
 
 
198 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.1 
 
 
193 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  47.55 
 
 
232 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.21 
 
 
224 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.21 
 
 
224 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  46.53 
 
 
213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.93 
 
 
152 aa  130  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.61 
 
 
208 aa  121  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.18 
 
 
241 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.38 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  51.37 
 
 
176 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.93 
 
 
249 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.48 
 
 
181 aa  113  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.62 
 
 
269 aa  103  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.5 
 
 
1011 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.5 
 
 
1011 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  41.79 
 
 
997 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.44 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688113  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  35.42 
 
 
1012 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  36.81 
 
 
1012 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  36.11 
 
 
980 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6673  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  36.62 
 
 
1019 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581747  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.5 
 
 
987 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.85 
 
 
222 aa  87.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  38.57 
 
 
221 aa  87  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.86 
 
 
983 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1301  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  40.16 
 
 
988 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.648743 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  38.13 
 
 
991 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.21 
 
 
185 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.69 
 
 
220 aa  80.5  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.79 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2227  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.17 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  35 
 
 
988 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 
223 aa  74.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.99 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  29.22 
 
 
1027 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.58 
 
 
254 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.87 
 
 
237 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.67 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.85 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.55 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.86 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  28.77 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.69 
 
 
225 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1492  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30 
 
 
216 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.619524  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.82 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.47 
 
 
241 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  30.41 
 
 
289 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5354  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.45 
 
 
204 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.29 
 
 
234 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.87 
 
 
241 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.14 
 
 
212 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  26.99 
 
 
253 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  31.43 
 
 
200 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.46 
 
 
253 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.86 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.19 
 
 
237 aa  57.4  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  32.41 
 
 
262 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  26.71 
 
 
206 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.61 
 
 
248 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.8 
 
 
244 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.32 
 
 
251 aa  53.9  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.19 
 
 
232 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0851  carbon monoxide dehydrogenase family protein  26.51 
 
 
242 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0856  carbon monoxide dehydrogenase family protein  26.51 
 
 
242 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>