65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3262 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 253 aa  510  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  92.06 
 
 		 253 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  64.71 
 
 		 248 aa  326  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0856  carbon monoxide dehydrogenase family protein  62.85 
 
 		 242 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229511  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0608  carbon monoxide dehydrogenase family protein  62.85 
 
 		 242 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.802203  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2442  carbon monoxide dehydrogenase family protein  62.85 
 
 		 242 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0851  carbon monoxide dehydrogenase family protein  62.85 
 
 		 242 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0056  carbon monoxide dehydrogenase family protein  62.85 
 
 		 242 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1016  hypothetical protein  62.85 
 
 		 242 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0678  hypothetical protein  62.45 
 
 		 242 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2533  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  59.52 
 
 		 235 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2660  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  59.13 
 
 		 235 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  57.54 
 
 		 235 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5944  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  56.75 
 
 		 235 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.163492 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2613  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  57.14 
 
 		 235 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2003  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  57.14 
 
 		 235 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210005  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0685  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.19 
 
 		 235 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.31708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  30.49 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  29.22 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.21 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.85 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.21 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.13 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.01 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.03 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.56 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.11 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.99 
 
 		 147 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.34 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.12 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.2 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.39 
 
 		 216 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  29.3 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.55 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  26.57 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.12 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.68 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  25.95 
 
 		 161 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.49 
 
 		 156 aa  62  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.45 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  26.97 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.34 
 
 		 148 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.46 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  26.97 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.69 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.74 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.97 
 
 		 158 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.46 
 
 		 151 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.53 
 
 		 152 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  23.53 
 
 		 176 aa  52  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.5 
 
 		 223 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.34 
 
 		 151 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2227  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.34 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.67 
 
 		 208 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.21 
 
 		 151 aa  50.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.88 
 
 		 152 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.05 
 
 		 152 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688113  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.06 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.68 
 
 		 157 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.32 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.18 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>