47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2660 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2660  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2533  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  98.72 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  88.46 
 
 		 235 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2613  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  88.03 
 
 		 235 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2003  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  88.03 
 
 		 235 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210005  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5944  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  85.96 
 
 		 235 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.163492 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2442  carbon monoxide dehydrogenase family protein  69.01 
 
 		 242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0056  carbon monoxide dehydrogenase family protein  69.01 
 
 		 242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1016  hypothetical protein  69.01 
 
 		 242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0608  carbon monoxide dehydrogenase family protein  69.01 
 
 		 242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.802203  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0678  hypothetical protein  69.01 
 
 		 242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0851  carbon monoxide dehydrogenase family protein  69.01 
 
 		 242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0856  carbon monoxide dehydrogenase family protein  69.01 
 
 		 242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229511  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0685  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  75.21 
 
 		 235 aa  321  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.31708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  59.52 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  60.98 
 
 		 248 aa  278  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  57.54 
 
 		 253 aa  268  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.33 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.14 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  29.73 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.95 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.05 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  27.85 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.48 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.48 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.95 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  25.43 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.69 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.12 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.45 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.11 
 
 		 154 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.64 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.32 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  26.32 
 
 		 176 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.68 
 
 		 148 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.85 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.9 
 
 		 156 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.2 
 
 		 154 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.64 
 
 		 148 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.49 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  28.93 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.06 
 
 		 155 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.62 
 
 		 147 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.24 
 
 		 197 aa  45.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.48 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  23.78 
 
 		 150 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  23.08 
 
 		 150 aa  42  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>