94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2227 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2227  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 229 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  62.34 
 
 		 222 aa  241  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  50.66 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.42 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.45 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1492  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  54.48 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.619524  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5354  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.36 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.74 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.41 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.13 
 
 		 241 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.09 
 
 		 198 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.09 
 
 		 154 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.18 
 
 		 154 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.75 
 
 		 152 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.55 
 
 		 204 aa  98.2  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  35.52 
 
 		 213 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.81 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.64 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.85 
 
 		 197 aa  92.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.06 
 
 		 193 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.24 
 
 		 154 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.73 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.43 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  34.06 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.51 
 
 		 182 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.28 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.28 
 
 		 148 aa  88.6  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  32.12 
 
 		 148 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 1011 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.47 
 
 		 151 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.47 
 
 		 153 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 1011 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  34.06 
 
 		 161 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.98 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.34 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.11 
 
 		 155 aa  86.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.37 
 
 		 155 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.58 
 
 		 158 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32 
 
 		 246 aa  84.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.79 
 
 		 176 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 		 147 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  32.61 
 
 		 980 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.01 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  33.1 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.12 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  31.88 
 
 		 1012 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  32.12 
 
 		 1012 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.66 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.81 
 
 		 151 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  32.12 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  30.13 
 
 		 997 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6673  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  34.75 
 
 		 1019 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.81 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  27.86 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.26 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  27.86 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 983 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  33.56 
 
 		 987 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.86 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  31.16 
 
 		 988 aa  70.1  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.86 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.48 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.82 
 
 		 152 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.01 
 
 		 152 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  32.03 
 
 		 991 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.69 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.24 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.03 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1301  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  31.4 
 
 		 988 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.648743 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.24 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.14 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.34 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  28.24 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.18 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.18 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.18 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.6 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.53 
 
 		 153 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.45 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0569  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.22 
 
 		 148 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0217411 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.28 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.94 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  26.81 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.9 
 
 		 185 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4237  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.19 
 
 		 469 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.41 
 
 		 147 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.77 
 
 		 154 aa  45.8  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.06 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.68 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.26 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.8 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.85 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.91 
 
 		 306 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>