97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0593 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 244 aa  488  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.45 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.5 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  55.63 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  55.63 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  55.63 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  54.93 
 
 		 241 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.32 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  42.33 
 
 		 289 aa  158  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.68 
 
 		 147 aa  155  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4922  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.48 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.68 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.68 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.68 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4709  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.46 
 
 		 240 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.24 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  44.44 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.89 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.02 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  36.58 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4318  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.7 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.531167  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4237  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.53 
 
 		 469 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3967  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.62 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.07 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.54 
 
 		 198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5312  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.1 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.19 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.16 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.84 
 
 		 237 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.08 
 
 		 241 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.43 
 
 		 306 aa  93.2  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  33.77 
 
 		 1027 aa  88.6  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.59 
 
 		 405 aa  82  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  30.51 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5697  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.81 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407946 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5832  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.21 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671661  hitchhiker  0.00379539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3792  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding:carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.59 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100636  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  29.94 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0646  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.25 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3140  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.25 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0169757  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2945  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.88 
 
 		 182 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0435616  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4550  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.8 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  28.97 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.65 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  28.1 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.5 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.67 
 
 		 155 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.9 
 
 		 147 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.22 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  26.55 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.33 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.65 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  31.08 
 
 		 988 aa  55.8  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  26.92 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.58 
 
 		 153 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.95 
 
 		 151 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.8 
 
 		 154 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 		 148 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  28.48 
 
 		 997 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  27.03 
 
 		 232 aa  52  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.21 
 
 		 154 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.67 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.1 
 
 		 983 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.3 
 
 		 151 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  31.85 
 
 		 987 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.1 
 
 		 155 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.21 
 
 		 213 aa  48.9  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.03 
 
 		 154 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.69 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3913  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.54 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0164888  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.81 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8407  hypothetical protein  27.85 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 		 187 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 		 151 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  31.65 
 
 		 991 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.03 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.33 
 
 		 152 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.34 
 
 		 158 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.87 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.34 
 
 		 158 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.81 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  24.67 
 
 		 150 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  26.72 
 
 		 1011 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  26.72 
 
 		 1011 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0478  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29 
 
 		 145 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.49685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.87 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.38 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  24.67 
 
 		 150 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  27.08 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  25.31 
 
 		 161 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.26 
 
 		 141 aa  42.7  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.89 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.89 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.71 
 
 		 158 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 		 204 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>