72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3140 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3140  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
182 aa  340  8e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0169757  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  95.03 
 
 
182 aa  318  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2945  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  89.5 
 
 
182 aa  299  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0435616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.72 
 
 
306 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.77 
 
 
237 aa  90.1  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  35.03 
 
 
289 aa  84.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.37 
 
 
208 aa  84.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.93 
 
 
251 aa  84.3  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  27.66 
 
 
1027 aa  83.2  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.62 
 
 
185 aa  82  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.87 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.24 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.24 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.24 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4922  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.25 
 
 
295 aa  74.7  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4237  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.58 
 
 
469 aa  74.3  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.89 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.95 
 
 
240 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.95 
 
 
240 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.95 
 
 
240 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.74 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.83 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.89 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4318  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.531167  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  27.23 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5312  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.67 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.11 
 
 
244 aa  67.8  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  30.07 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.32 
 
 
234 aa  64.7  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.81 
 
 
198 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 
225 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  23.49 
 
 
208 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4709  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.76 
 
 
240 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  25.71 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.16 
 
 
237 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3967  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.62 
 
 
246 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  29.3 
 
 
176 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.3 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.75 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.5 
 
 
254 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.46 
 
 
241 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.32 
 
 
148 aa  51.2  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.9 
 
 
246 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  26.67 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3913  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 
221 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0164888  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.92 
 
 
224 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.22 
 
 
155 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5832  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  30.46 
 
 
399 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671661  hitchhiker  0.00379539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.92 
 
 
224 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.83 
 
 
153 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.02 
 
 
249 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.24 
 
 
155 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.5 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 
154 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  27.56 
 
 
241 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.75 
 
 
216 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.92 
 
 
147 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.5 
 
 
154 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0646  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  29.65 
 
 
405 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.85 
 
 
156 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.68 
 
 
148 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.52 
 
 
154 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 
152 aa  44.7  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688113  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26 
 
 
157 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.11 
 
 
198 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  26.62 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.83 
 
 
193 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.32 
 
 
151 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5697  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.18 
 
 
400 aa  41.6  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.83 
 
 
151 aa  41.2  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.15 
 
 
182 aa  41.2  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>