63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4550 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4550  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 227 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  68.88 
 
 		 241 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.64 
 
 		 405 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3792  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding:carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.09 
 
 		 390 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5697  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.3 
 
 		 400 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0646  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.67 
 
 		 405 aa  89.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5832  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.37 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671661  hitchhiker  0.00379539 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.9 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.5 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  33.55 
 
 		 289 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4922  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.14 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3967  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.92 
 
 		 246 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.76 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.08 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  29.05 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.74 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3913  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.46 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0164888  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4709  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.76 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.21 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.45 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  29.73 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.08 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.77 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.87 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.87 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.87 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.38 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.38 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.38 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4318  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.79 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.531167  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5312  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.38 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.97 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  26.58 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  24.77 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.97 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.59 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4237  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.93 
 
 		 469 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  23.65 
 
 		 1027 aa  55.5  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.83 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.94 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  27.21 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.58 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.81 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.7 
 
 		 154 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  29.05 
 
 		 148 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.35 
 
 		 154 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.81 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  29.53 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.67 
 
 		 224 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.52 
 
 		 254 aa  48.9  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.92 
 
 		 254 aa  48.5  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.67 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.68 
 
 		 156 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.5 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.36 
 
 		 148 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.9 
 
 		 187 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.14 
 
 		 158 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.97 
 
 		 147 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.49 
 
 		 157 aa  42.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.71 
 
 		 213 aa  41.6  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>