65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3967 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3967  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 246 aa  495  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4922  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  56 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5312  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.1 
 
 		 232 aa  148  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.67 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4318  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.02 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.531167  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.94 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.33 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  43.21 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4709  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.67 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  40.72 
 
 		 200 aa  135  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.12 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.12 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.12 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  42.72 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.26 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.26 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.26 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.54 
 
 		 147 aa  128  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.62 
 
 		 244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4237  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.14 
 
 		 469 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.95 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.71 
 
 		 198 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.91 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.22 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.69 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.58 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.36 
 
 		 208 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.68 
 
 		 185 aa  89.4  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.49 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4550  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.92 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  29.57 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3792  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding:carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.97 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100636  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  31.88 
 
 		 1027 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  27.62 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  29.66 
 
 		 405 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  29.41 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5697  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.24 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407946 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2945  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.63 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0435616  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.62 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0646  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  30 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3140  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.62 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0169757  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5832  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  29.79 
 
 		 399 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671661  hitchhiker  0.00379539 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.54 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.73 
 
 		 216 aa  52.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.9 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.45 
 
 		 156 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.84 
 
 		 158 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  27.74 
 
 		 161 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.31 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  23.6 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.32 
 
 		 157 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.2 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.68 
 
 		 154 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.53 
 
 		 182 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3913  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.32 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0164888  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.07 
 
 		 176 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.68 
 
 		 154 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.75 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  24.58 
 
 		 176 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.75 
 
 		 224 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  24.31 
 
 		 148 aa  42  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.37 
 
 		 197 aa  42  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>