70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4922 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4922  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 295 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  39.02 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4709  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.45 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  43.11 
 
 		 262 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58.67 
 
 		 240 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58.67 
 
 		 240 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58.67 
 
 		 240 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5312  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  55.26 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.6 
 
 		 222 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4237  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  54.74 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.6 
 
 		 222 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.6 
 
 		 222 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.47 
 
 		 251 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3967  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  56.58 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  54.73 
 
 		 232 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  53.79 
 
 		 241 aa  166  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  48.21 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.33 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.35 
 
 		 234 aa  158  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4318  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.86 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.531167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.28 
 
 		 212 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.32 
 
 		 147 aa  155  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.02 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.07 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.49 
 
 		 198 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.48 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.42 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.13 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.14 
 
 		 208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.86 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.67 
 
 		 185 aa  93.6  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  33.13 
 
 		 208 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3792  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding:carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.51 
 
 		 390 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100636  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  30.72 
 
 		 206 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  29.11 
 
 		 1027 aa  87  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.5 
 
 		 405 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2945  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.21 
 
 		 182 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0435616  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4550  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.12 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  32.31 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.25 
 
 		 182 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3140  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.25 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0169757  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0646  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.51 
 
 		 405 aa  69.3  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5697  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.51 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407946 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5832  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.12 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671661  hitchhiker  0.00379539 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.63 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.66 
 
 		 241 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.7 
 
 		 224 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.7 
 
 		 224 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 		 216 aa  52.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.11 
 
 		 269 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.49 
 
 		 193 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.06 
 
 		 156 aa  52.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  27.27 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.39 
 
 		 147 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  24.32 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.21 
 
 		 157 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.22 
 
 		 198 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.03 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8407  hypothetical protein  29.08 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.39 
 
 		 154 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.3 
 
 		 155 aa  46.6  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3913  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.95 
 
 		 221 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0164888  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  24.67 
 
 		 161 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.83 
 
 		 154 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 		 182 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.21 
 
 		 178 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  25 
 
 		 176 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.2 
 
 		 153 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 		 176 aa  42.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>