59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5312 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5312  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4922  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  56.85 
 
 		 295 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3967  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.1 
 
 		 246 aa  148  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4318  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.71 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.531167  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.4 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4709  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.26 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  48.2 
 
 		 289 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4237  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.93 
 
 		 469 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.57 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.18 
 
 		 237 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.15 
 
 		 147 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.92 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  37.61 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.92 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.92 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.77 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.24 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.63 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.63 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.63 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.47 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  38.41 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.3 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.56 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.22 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.86 
 
 		 225 aa  99  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.78 
 
 		 254 aa  95.5  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.87 
 
 		 306 aa  86.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.78 
 
 		 185 aa  86.3  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.29 
 
 		 208 aa  85.5  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.76 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3792  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding:carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.51 
 
 		 390 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100636  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  30.52 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0646  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.56 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2945  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.86 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0435616  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  26.9 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5697  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.13 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407946 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3140  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.67 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0169757  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  26.11 
 
 		 1027 aa  68.6  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  25.52 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5832  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  28.99 
 
 		 399 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671661  hitchhiker  0.00379539 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  28.75 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4550  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.48 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.79 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.29 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.17 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.32 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.39 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3913  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.25 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0164888  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.52 
 
 		 154 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.14 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.77 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.23 
 
 		 154 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.77 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.23 
 
 		 158 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  23.4 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  25 
 
 		 161 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.71 
 
 		 147 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>