55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4415 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4415  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 150 aa  303  7e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.86 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  28 
 
 		 1027 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.43 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.43 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.41 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  27.97 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  26 
 
 		 289 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  28.57 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.06 
 
 		 198 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  26 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  27.08 
 
 		 405 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4709  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.39 
 
 		 240 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.19 
 
 		 208 aa  50.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.66 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.45 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.91 
 
 		 198 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.12 
 
 		 306 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.48 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.34 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  25.56 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.67 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  24.18 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.09 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  28.77 
 
 		 262 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  26.35 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  26.42 
 
 		 241 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.97 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.15 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.49 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.7 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4922  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.94 
 
 		 295 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.15 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.57 
 
 		 246 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.38 
 
 		 251 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.57 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.62 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.11 
 
 		 237 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.68 
 
 		 254 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.65 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.97 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.4 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  25.66 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  18.67 
 
 		 149 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  24.41 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3792  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding:carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.92 
 
 		 390 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100636  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.33 
 
 		 240 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.33 
 
 		 240 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.36 
 
 		 244 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.33 
 
 		 240 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  26.15 
 
 		 1012 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  20.93 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4237  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.43 
 
 		 469 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>